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关于孪晶的处理的几个问题
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最近碰上一个孪晶,空间群是P21,指标化率是这样构成的Part 1 96.8%, Part 2 5.9%, 剩余的unindexed 2% 其中Part 1 和part 2为 [-1 0 0 0 1 0 0 0 -1],即ac轴互为反向,b轴相同。 于是我开始按单晶直接还原,忽略掉了那5.9%。一解发现Part 1里面本身是一个倒反孪晶(invert),BASF大概0.49左右。 我在check的时候,遇到了三个C类错误, 一个是STRVA01_ALERT_4_C Flack test results are ambiguous. From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack 0.496 From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su 0.007 这个问题似乎是要我给出精修时acutual Friedel对的数量,具体提示是看Merg 2和Merg 3的差,请问具体怎么操作?我开始尝试是在ins里分解加Merg 2和Merg 3再到cif中去找二者的差,但是当我用Merg 3时,无法精修,提示是ACTA命令对于Merg >3的非心群来说无法运行。 另外我看到论坛里Xi老师之前写的一篇文章说是找完差以后,还要加一行_chemical_absolute_configuration ad。这是什么意思? 第二个是PLAT090_ALERT_3_C Poor Data / Parameter Ratio (Zmax > 18) ........ 9.55 Note 因为我结构里很多甲基,我绝大多数按的AFIX 137修的,是不是把一部分137改成43可以解决这个问题? 第三个是PLAT094_ALERT_2_C Ratio of Maximum / Minimum Residual Density .... 2.32 Report 这个问题要紧吗?还是说必须要把Part 1和Part 2先分开,然后再拿part 1当invert twin来解? 再次感谢。 |
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