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zs806750658
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[交流]
LAMMPS输出的库伦能为什么是正值，而MS的discover算出的库伦能是负值 已有4人参与
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| 相同的模型，相同的系宗，相同的力场，相同的参数设置，为什么用Material Studio的discover计算的单点能中库伦能是-4万多，而Lammps跑完输出的能量中库伦能是正5万多,看过手册发现两个软件计算库伦能的函数是一样的，为什么相差如此之大呢。而其他的范德华能、键能等相差不是很大，哪位高手能给予指点，不胜感激 |
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我现在想了下，ecoul为什么是正值也许可以从以下方式理解。正如我前面所述的NaCl电荷点阵分布，因为最近的正负电荷其实在力场中已经有成键的参数bond coeffs来描述，所以这部分吸引力在计算时就不计在内，后面自然是从次近邻的电荷之间的静电力算起，次近邻是同性电荷所以结果是能量为正值。 如果把原子电荷的描述从full改成charge的话，那么最近邻的电荷之间就是异性电荷，能量为负值，我测试过个例子，把atom style从full改成charge计算出来的能量的确为负值。 但是这种理解方式却不能解释elong有时候比ecoul绝对值大，至少NaCl应该不能解释，有可能一些电荷的排布方式会造成ecoul绝对值小于elong。 |
15楼2015-11-16 08:55:01
lsloneil
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你用的是什么pair_style， 又是怎么把静电能输出的？ 如果你使用的相互作用势利用ewald summation或 pppm 来计算静电相互作用，那么静电相互作用被分为短程（实空间）和长程（倒空间）两部分进行计算。在用thermo_style进行输出时，ecoul对应于短程部分，通常是正值，elong对应于长程部分，通常是负值，两者之和才是总静电相互作用能。 类似的帖子 http://simulation.haotui.com/viewthread.php?tid=23854 |
2楼2015-06-01 06:08:18
zs806750658 
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3楼2015-06-02 04:25:18
lsloneil
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4楼2015-06-02 09:34:05
