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gaussian 09 做刚性扫描 scan 问题求助 已有2人参与
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我想做两个分子体系的刚性扫描，如图，扫描第6号C和50号氧的键长。可是下面坐标里没有标出这个键，请问我该怎么输入？如果按照opt=modredundant那样的输入，例如5 60 1.4 S 10 0.2 ，只进行一步就结束了。 求大神指教 C H 1 B1 H 1 B2 2 A1 H 1 B3 2 A2 3 D1 0 C 1 B4 2 A3 4 D2 0 C 5 B5 1 A4 2 D3 0 H 6 B6 5 A5 1 D4 0 C 6 B7 5 A6 1 D5 0 H 8 B8 6 A7 5 D6 0 H 8 B9 6 A8 5 D7 0 C 8 B10 6 A9 5 D8 0 H 11 B11 8 A10 6 D9 0 H 11 B12 8 A11 6 D10 0 C 11 B13 8 A12 6 D11 0 H 14 B14 11 A13 8 D12 0 H 14 B15 11 A14 8 D13 0 C 5 B16 1 A15 6 D14 0 H 17 B17 5 A16 1 D15 0 H 17 B18 5 A17 1 D16 0 H 17 B19 5 A18 1 D17 0 C 11 B20 8 A19 6 D18 0 H 21 B21 11 A20 8 D19 0 H 21 B22 11 A21 8 D20 0 H 21 B23 11 A22 8 D21 0 O 14 B24 11 A23 8 D22 0 C 25 B25 14 A24 11 D23 0 C 26 B26 25 A25 14 D24 0 H 27 B27 26 A26 25 D25 0 H 27 B28 26 A27 25 D26 0 H 27 B29 26 A28 25 D27 0 O 26 B30 25 A29 14 D28 0 C 21 B31 11 A30 8 D29 0 H 32 B32 21 A31 11 D30 0 C 14 B33 11 A32 8 D31 0 H 34 B34 14 A33 11 D32 0 H 34 B35 14 A34 11 D33 0 O 5 B36 1 A35 17 D34 0 H 37 B37 5 A36 1 D35 0 C 6 B38 5 A37 1 D36 0 C 39 B39 6 A38 5 D37 0 C 40 B40 39 A39 6 D38 0 C 41 B41 40 A40 39 D39 0 C 42 B42 41 A41 40 D40 0 C 43 B43 42 A42 41 D41 0 H 40 B44 39 A43 6 D42 0 H 42 B45 41 A44 40 D43 0 H 43 B46 42 A45 41 D44 0 O 44 B47 43 A46 42 D45 0 H 48 B48 44 A47 43 D46 0 O 39 B49 6 A48 5 D47 0 C 41 B50 40 A49 39 D48 0 H 51 B51 41 A50 40 D49 0 H 51 B52 41 A51 40 D50 0 C 51 B53 41 A52 40 D51 0 H 54 B54 51 A53 41 D52 0 H 54 B55 51 A54 41 D53 0 O 54 B56 51 A55 41 D54 0 H 57 B57 54 A56 51 D55 0 B1 1.08256091 B2 1.08595188 B3 1.08425127 B4 1.52663062 B5 1.54298318 B6 1.08028226 B7 1.54139954 B8 1.08426942 B9 1.08378134 B10 1.54041887 B11 1.08923783 B12 1.08415513 B13 3.87873192 B14 1.08236822 B15 1.07949439 B16 1.52740665 B17 1.08294896 B18 1.08642398 B19 1.08499521 B20 2.54524802 B21 1.08805988 B22 1.08460282 B23 1.08435490 B24 1.42621602 B25 1.32477952 B26 1.50414477 B27 1.08002561 B28 1.08403663 B29 1.08392078 B30 1.19116867 B31 1.53342465 B32 1.09011623 B33 1.51888869 B34 1.08774007 B35 1.08607216 B36 1.41691950 B37 0.94669071 B38 2.40705776 B39 1.39120517 B40 1.39012360 B41 1.39350331 B42 1.38109706 B43 1.38433831 B44 1.07559829 B45 1.07737895 B46 1.07476471 B47 1.35754202 B48 0.94791945 B49 1.36593780 B50 1.51587575 B51 1.08582596 B52 1.08449640 B53 1.52686015 B54 1.08566918 B55 1.08746110 B56 1.40510656 B57 0.94671886 A1 109.12037246 A2 108.89499226 A3 111.32493627 A4 110.23960694 A5 105.34430605 A6 115.94263461 A7 108.46226751 A8 110.44210890 A9 112.97321691 A10 109.20685919 A11 109.14464112 A12 136.77651473 A13 95.55463071 A14 106.38316007 A15 110.40481748 A16 110.86779760 A17 111.90787196 A18 109.55738775 A19 94.78423351 A20 93.51154340 A21 91.02978763 A22 145.92858439 A23 128.32134357 A24 117.12181179 A25 111.95515151 A26 109.52493681 A27 109.76388038 A28 109.83561430 A29 123.37227236 A30 33.98457646 A31 107.88865508 A32 21.05701294 A33 109.42252663 A34 108.17869499 A35 104.84593000 A36 111.09147318 A37 136.53414798 A38 130.12530110 A39 121.27805034 A40 117.86940468 A41 121.17154586 A42 120.11763893 A43 118.01267926 A44 119.87615211 A45 121.24098698 A46 118.42254845 A47 110.09450208 A48 31.67689022 A49 122.58630559 A50 110.29501884 A51 110.75755227 A52 111.71725816 A53 110.14440825 A54 109.91078009 A55 108.21157359 A56 110.40234866 D1 117.13596854 D2 120.91612495 D3 64.21421731 D4 55.09666741 D5 174.38496703 D6 110.31763278 D7 -4.87773041 D8 -127.50665545 D9 80.50586542 D10 -34.94293932 D11 -147.06446721 D12 48.70617255 D13 -61.93898128 D14 -126.15096178 D15 62.24237115 D16 -177.32053632 D17 -57.65799618 D18 175.27644619 D19 -108.63788162 D20 -0.76043149 D21 121.95407254 D22 167.72082064 D23 -173.59476395 D24 -179.93644643 D25 179.44421223 D26 -59.71670807 D27 58.48550235 D28 0.10133177 D29 128.10735169 D30 -117.30805075 D31 -172.07492027 D32 134.75643727 D33 -109.21886371 D34 -119.15948102 D35 161.89008705 D36 -58.73729235 D37 -86.24143083 D38 -141.87075022 D39 1.99109084 D40 -5.05826317 D41 1.79057650 D42 37.84812519 D43 177.06077875 D44 -176.67800271 D45 -177.05324620 D46 151.35693380 D47 -2.95910519 D48 -176.84249319 D49 -125.60799608 D50 -7.43792189 D51 114.26376058 D52 52.40308773 D53 -66.21654010 D54 172.74188622 D55 178.53533209 1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 1.0 2 3 4 5 6 1.0 17 1.0 37 1.0 6 7 1.0 8 1.0 50 1.0 7 8 9 1.0 10 1.0 11 1.0 9 10 11 12 1.0 13 1.0 32 1.0 12 13 14 15 1.0 16 1.0 25 1.0 34 1.0 15 16 17 18 1.0 19 1.0 20 1.0 18 19 20 21 22 1.0 23 1.0 24 1.0 32 1.0 22 23 24 25 26 1.5 26 27 1.0 31 2.0 27 28 1.0 29 1.0 30 1.0 28 29 30 31 32 33 1.0 34 1.0 33 34 35 1.0 36 1.0 35 36 37 38 1.0 38 39 40 1.5 44 1.5 50 1.0 40 41 1.5 45 1.0 41 42 1.5 51 1.0 42 43 2.0 46 1.0 43 44 2.0 47 1.0 44 48 1.0 45 46 47 48 49 1.0 49 50 51 52 1.0 53 1.0 54 1.0 52 53 54 55 1.0 56 1.0 57 1.0 55 56 57 58 1.0 58  1.png |
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