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lujunyan1118

金虫 (小有名气)

[求助] Gaussian D01做relaxed surface scan的一个问题,可能是bug 已有2人参与

各位大侠好,小弟要用g09做一个relaxed surface scan

RC的坐标这么写的: B 1701 1593 1.50 S 10 -0.020000
想扫描一个键长,从1.50A开始,扫描10步,每步减少0.02A。

之前用g09 A02没有问题,可以正常扫描,但是g09 A02有一个bug,会经常出现internal coordinate error。

后来换了g09 D01, 没有internal coordinate error的问题了。但是似乎扫描的时候不能从指定的键长(1.50A)开始扫描,高斯非要把初始结构优化到最低点。这是个g09 D01的bug 还是g09 D01做scan的写法改掉了?

谢谢啦~
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gauss98

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lujunyan1118: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-08-29 12:50:17
本帖内容被屏蔽

2楼2014-08-29 11:08:48
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lujunyan1118

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gauss98 at 2014-08-29 11:08:48
去掉1.50,因为你的实际分子结构键长可能不是1.50

我是现用0.1 A的步长做scan,然后在过渡态附近将步长缩短到0.02A 再做scan。 在过渡态附近,这个键长是1.50 A的。
之前用g09 A02版本可以从1.50A开始正常scan,除了一些构象会出现internal coordinate error的问题
3楼2014-08-29 12:17:32
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lujunyan1118: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-08-29 12:50:11
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7776812&fpage=3
这个帖子里的问题就是你遇到的问题。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2014-08-29 12:36:40
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lujunyan1118

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-08-29 12:36:40
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7776812&fpage=3
这个帖子里的问题就是你遇到的问题。

原来如此,谢谢!
不过这样的新要求也很不方便了。。。
5楼2014-08-29 12:50:02
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送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-08-29 12:36:40
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7776812&fpage=3
这个帖子里的问题就是你遇到的问题。

6楼2017-08-20 20:59:23
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