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heaven68

金虫 (著名写手)

绿萝

[求助] 两个结构相同的晶体结构 已有4人参与

各位大侠,
       最近做出两个结构相同的晶体结构,只是金属不同,由于有一个桥连的甲基不好加氢,找的单晶室老师帮忙解决的。另一个金属的晶体结构也存在这个加氢的问题,据说是要把前一个晶体中所有原子的坐标copy过去,把金属改一下,修一轮就就可以解决。但问题是我也是初学者,不太明白什么意思?有没有了解的大侠,求赐教,不胜感激!
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guangdzhuh

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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heaven68: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-05-27 21:42:37
先对未加氢的那个文件进行xprep得到ins文件,这里要确保xprep时选择正确的空间群。然后打开旧的(已经加氢的)数据的ins文件,从SFAC这行(一般是第五行,包括这行)开始,一直到后面的END行,全部选中,然后复制粘贴到新的数据的ins文件的相应的行的位置。把SFAC行和坐标中对应的金属原子符号改过来,修改或删掉某些限制命令,因为衍射不同,旧的文件限制命令不一定适用于新的。然后保存,xl精修就可以了,多精修几轮,然后改权重啥的。
8楼2015-05-23 09:48:59
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brilliant

捐助贵宾 (职业作家)

【答案】应助回帖

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有可能是同一个晶体,金属放错了,比较下晶胞参数有多大差别(当然系列稀土元素的配合物晶胞参数相似度大一些)
2楼2015-05-22 13:17:28
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heaven68

金虫 (著名写手)

绿萝

引用回帖:
2楼: Originally posted by brilliant at 2015-05-22 13:17:28
有可能是同一个晶体,金属放错了,比较下晶胞参数有多大差别(当然系列稀土元素的配合物晶胞参数相似度大一些)

我的意思是就是两种金属,相似度很大,就是想偷个懒,把A的坐标拷到B,就不用再麻烦加氢了,因为有一个碳的H比较难加。
我就是不知道具体怎么操作
3楼2015-05-22 17:11:18
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信


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4楼2015-05-22 17:47:54
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