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如何得到accession no和相似度的？ 已有1人参与
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看到一篇PANS上的文章，里面菌株测序后进行生物信息学分析，但是不知道里面的accession no和相似度如何得到的？ Direct cloning and refactoring of a silent lipopeptide biosynthetic gene cluster yields the antibiotic taromycin A 作者是这样描述的： Bioinformatics Analysis of the tar Gene Cluster. The draft genome of Saccharomonospora sp. CNQ-490 was sequenced at the Joint Genome Institute (project ID: 407426). The bioinformatics program antiSMASH (http://antismash.secondarymetabolites.org/) (53) was initially used to analyze the whole genome sequence. The sequence of the orphan 67-kb NRPS gene cluster tar encoded on contig-9 (B126DRAFT_scaffold 9.10; 14,775–81,515 nt) was further analyzed and annotated using FramePlot 3.0 (54) (http://watson.nih.go.jp/～jun/cgi-bin/frameplot-3.0b.pl) and BLAST (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov). The amino acid specificity codes for adenylation domains in NRPS enzymes were analyzed using NRPSpredictor2 (http://nrps.informatik.uni-tuebi ... ler?cmd=SubmitJob). 序列信息：见附件。 就是途中黑框所示的两列是如何得到的？谢谢，搞了好几天了，郁闷啊。  Snap1.jpg |
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2015-05-18 22:27:12, 22.12 K
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