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Charlie2013_

银虫 (小有名气)

[求助] 关于Popgene对SSR标记后期数据分析的问题。 已有1人参与

没用过Popgene这个软件,看了说明头还是很大。
Q1:population数指的是什么?我做的是单一物种的13个品种,那是输入population=13吗?
Q2:SSR标记是选择diploid database,co-dominant marker这一项,AB是如何标注的。
我的实验材料大多都是多倍体,那么是不是就不能使用diploid的了?
我应该怎么统计?
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Charlie2013_

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xianxianzzc at 2015-08-14 11:42:21
你好,请问你上面的问题解决了吗?我做的是AFLP,不太会用这个软件

你好,我的材料是多倍体 应该是不能用这个软件~
所以之后的问题也没有解决~
5楼2015-08-28 10:09:25
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xianxianzzc

新虫 (初入文坛)

你好,请问你上面的问题解决了吗?我做的是AFLP,不太会用这个软件
2楼2015-08-14 11:42:21
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lyzjc

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1.population数指的是群体数目,几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型,每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小,而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小,软件不直接识别数字,用字母代替了等位基因的大小了。

关于软件的使用以及怎么统计,重要的是数据的录入格式,这个很重要,好好看看说明书吧。
zhaijc@foxmail.com
3楼2015-08-14 16:27:22
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kxs2001

金虫 (著名写手)

我也想知道,多倍体用什么软件!
我知道,主爱我!
4楼2015-08-24 15:53:16
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