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Charlie2013_

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[求助] 关于Popgene对SSR标记后期数据分析的问题。已有1人参与

没用过Popgene这个软件，看了说明头还是很大。
Q1:population数指的是什么？我做的是单一物种的13个品种，那是输入population=13吗？
Q2:SSR标记是选择diploid database，co-dominant marker这一项，AB是如何标注的。
我的实验材料大多都是多倍体，那么是不是就不能使用diploid的了？
我应该怎么统计？

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ISSR分子标记中用Popgene计算相关参数时样本量的问题已经有16人回复
SSR标记带型分析已经有11人回复

1楼 2015-05-12 13:24:17

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xianxianzzc

新虫 (初入文坛)

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你好，请问你上面的问题解决了吗？我做的是AFLP，不太会用这个软件

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2楼2015-08-14 11:42:21

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lyzjc

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【答案】应助回帖

1.population数指的是群体数目，几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型，每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小，而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小，软件不直接识别数字，用字母代替了等位基因的大小了。

关于软件的使用以及怎么统计，重要的是数据的录入格式，这个很重要，好好看看说明书吧。

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zhaijc@foxmail.com

3楼2015-08-14 16:27:22

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kxs2001

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我也想知道，多倍体用什么软件！

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我知道，主爱我！

4楼2015-08-24 15:53:16

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Charlie2013_

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引用回帖:

2楼: Originally posted by xianxianzzc at 2015-08-14 11:42:21
你好，请问你上面的问题解决了吗？我做的是AFLP，不太会用这个软件

你好，我的材料是多倍体应该是不能用这个软件~
所以之后的问题也没有解决~

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5楼2015-08-28 10:09:25

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Charlie2013_

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引用回帖:

3楼: Originally posted by lyzjc at 2015-08-14 16:27:22
1.population数指的是群体数目，几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型，每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小，而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小，软件不直接识别数字，用字母代 ...

恩恩谢谢你~

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6楼2015-08-28 10:10:43

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