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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于Popgene对SSR标记后期数据分析的问题。
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Charlie2013_

银虫 (小有名气)

[求助] 关于Popgene对SSR标记后期数据分析的问题。 已有1人参与

没用过Popgene这个软件，看了说明头还是很大。
Q1:population数指的是什么？我做的是单一物种的13个品种，那是输入population=13吗？
Q2:SSR标记是选择diploid database，co-dominant marker这一项，AB是如何标注的。
我的实验材料大多都是多倍体，那么是不是就不能使用diploid的了？
我应该怎么统计？
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1楼 2015-05-12 13:24:17
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xianxianzzc

新虫 (初入文坛)
你好，请问你上面的问题解决了吗？我做的是AFLP，不太会用这个软件
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2楼2015-08-14 11:42:21
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lyzjc

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1.population数指的是群体数目，几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型，每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小，而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小，软件不直接识别数字，用字母代替了等位基因的大小了。

关于软件的使用以及怎么统计，重要的是数据的录入格式，这个很重要，好好看看说明书吧。
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zhaijc@foxmail.com
3楼2015-08-14 16:27:22
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kxs2001

金虫 (著名写手)
我也想知道，多倍体用什么软件！
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我知道，主爱我！
4楼2015-08-24 15:53:16
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Charlie2013_

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xianxianzzc at 2015-08-14 11:42:21
你好，请问你上面的问题解决了吗？我做的是AFLP，不太会用这个软件

你好，我的材料是多倍体 应该是不能用这个软件~
所以之后的问题也没有解决~
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5楼2015-08-28 10:09:25
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Charlie2013_

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lyzjc at 2015-08-14 16:27:22
1.population数指的是群体数目，几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型，每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小，而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小，软件不直接识别数字，用字母代 ...

恩恩 谢谢你~
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6楼2015-08-28 10:10:43
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Charlie2013_

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by kxs2001 at 2015-08-24 15:53:16
我也想知道，多倍体用什么软件！

貌似大多都是针对单倍体和二倍体的分析软件吧，还真不太了解~~~
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7楼2015-08-28 10:11:21
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Charlie2013_

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lyzjc at 2015-08-14 16:27:22
1.population数指的是群体数目，几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型，每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小，而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小，软件不直接识别数字，用字母代 ...

要是没有条带应该怎么表示？
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8楼2015-12-23 17:15:19
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