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关于Popgene对SSR标记后期数据分析的问题。
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Charlie2013_
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关于Popgene对SSR标记后期数据分析的问题。
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没用过Popgene这个软件,看了说明头还是很大。
Q1:population数指的是什么?我做的是单一物种的13个品种,那是输入population=13吗?
Q2:SSR标记是选择diploid database,co-dominant marker这一项,AB是如何标注的。
我的实验材料大多都是多倍体,那么是不是就不能使用diploid的了?
我应该怎么统计?
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2015-05-12 13:24:17
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xianxianzzc
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你好,请问你上面的问题解决了吗?我做的是AFLP,不太会用这个软件
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2015-08-14 11:42:21
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lyzjc
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【答案】应助回帖
1.population数指的是群体数目,几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型,每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小,而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小,软件不直接识别数字,用字母代替了等位基因的大小了。
关于软件的使用以及怎么统计,重要的是数据的录入格式,这个很重要,好好看看说明书吧。
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zhaijc@foxmail.com
3楼
2015-08-14 16:27:22
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我也想知道,多倍体用什么软件!
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我知道,主爱我!
4楼
2015-08-24 15:53:16
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2楼
:
Originally posted by
xianxianzzc
at 2015-08-14 11:42:21
你好,请问你上面的问题解决了吗?我做的是AFLP,不太会用这个软件
你好,我的材料是多倍体 应该是不能用这个软件~
所以之后的问题也没有解决~
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5楼
2015-08-28 10:09:25
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3楼
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lyzjc
at 2015-08-14 16:27:22
1.population数指的是群体数目,几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型,每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小,而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小,软件不直接识别数字,用字母代 ...
恩恩 谢谢你~
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6楼
2015-08-28 10:10:43
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kxs2001
at 2015-08-24 15:53:16
我也想知道,多倍体用什么软件!
貌似大多都是针对单倍体和二倍体的分析软件吧,还真不太了解~~~
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7楼
2015-08-28 10:11:21
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3楼
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lyzjc
at 2015-08-14 16:27:22
1.population数指的是群体数目,几个群体就写几。你就可以输13。
2.通过分型,每个微卫星位点都检测出几个等位基因片段大小,而这个ABCDE代表的就是每个微卫星位点下各等位基因大小,软件不直接识别数字,用字母代 ...
要是没有条带应该怎么表示?
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8楼
2015-12-23 17:15:19
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