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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 大家好，我想知道MS中计算扩散系数时，怎么考虑浓度的影响因素的？
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呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)

[求助] 大家好，我想知道MS中计算扩散系数时，怎么考虑浓度的影响因素的？ 已有1人参与

最近我计算离子在聚合物中的扩散系数，但是我想知道，这个analysis模块是怎么考虑扩散因子浓度、扩散基体厚度、还有时间等等因素的？？？
急求，谢谢各位了!!
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1楼 2015-05-11 09:24:18
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
呀呀杨会苗: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-05-14 10:35:46
引用回帖:
6楼: Originally posted by 呀呀杨会苗 at 2015-05-13 22:52:53
你好，我还有个问题，我现在计算MSD曲线，大概500ps的时候，最后的曲线出现了水平段，请问这是怎么回事呢？不应该是斜直线吗？下面图是截取的MSD最后一段。

MSD图片.png
...

MS 官方教程中讲过，MSD 的统计会随着时间的延长而逐渐失去准确性，所以 analysis中会默认统计时间为总模拟时间的一半。而模拟时间最开始的一段也要舍去，所以扩散系数的计算只取中间一段时间。具体参见官方教程解释。

[ 发自小木虫客户端 ]
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
7楼2015-05-13 23:06:48
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呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by congtaiupc at 2015-05-11 16:12:35
期待大家的回答

3楼2015-05-11 20:28:27
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
呀呀杨会苗: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-05-13 12:02:00
通过分析MSD计算扩散系数，计算的正是在当前扩散因子浓度、扩散基体厚度、模拟温度情况下的扩散系数。
如果你要计算不同扩散因子浓度、扩散基体厚度、温度下的扩散系数，需要你重新构建模型，把扩散因子浓度、扩散基体厚度反映出来，举个例子来说，比如目前模型中扩散因子只有1个分子，把扩散因子分子数增加到5个，计算出来的就是扩散因子浓度增大后的扩散系数。
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呀呀杨会苗
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2015-05-12 16:52:38
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congtaiupc

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-05-12 16:52:38
通过分析MSD计算扩散系数，计算的正是在当前扩散因子浓度、扩散基体厚度、模拟温度情况下的扩散系数。
如果你要计算不同扩散因子浓度、扩散基体厚度、温度下的扩散系数，需要你重新构建模型，把扩散因子浓度、扩散 ...

嗯，有道理
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用青春书写青春
5楼2015-05-13 11:13:41
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