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红颜不美

金虫 (正式写手)

[求助] NAMD-ABF的方法算自由能其结果分析

想问一下用ABF的方法算自由能,其结果是怎么处理的
教程上得到的pmf文件值都是正值但是画出的自由能曲线的取值却不是正值而是负值?
我想问一下ABF方法得出的pmf文件中的能量指的就是自由能△G吗?
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计算模拟biubiu
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红颜不美

金虫 (正式写手)

自己顶
计算模拟biubiu
2楼2015-05-07 20:56:40
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红颜不美

金虫 (正式写手)

自己默默地顶起
想问一下大家 我算分子聚集 两分子是趋向聚集的 但是算出来的pmf值确实正值 老师说是负值才对 这是怎么回事?
计算模拟biubiu
3楼2015-05-08 16:07:13
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红颜不美

金虫 (正式写手)

求大神
计算模拟biubiu
4楼2015-05-11 09:31:04
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