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张楠楠的

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何在芯片数据中寻找目标序列? 已有1人参与

已有基因芯片数据,想从里面寻找到与拟南芥MAPKKK同源的基因序列。请问如何寻找?
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
需要知道你目的序列的探针,用探针去芯片里去找。目的序列的探针也可以通过用目的序列去BLAST你需要的探针库。
2楼2015-05-04 19:51:01
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张楠楠的

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
谢谢你的回复!
不知道你描述的跟我理解的是不是一个意思(原谅我水平太low)。我所理解的是把拟南芥的基因序列和芯片数据的序列进行比对,然后找到同源性较高的基因芯片。但是基因芯片的序列好多有上万个,我是要挨个比对吗?有没有什么简洁快速的方法呢?
3楼2015-05-05 10:23:39
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