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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 如何在芯片数据中寻找目标序列？
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张楠楠的

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何在芯片数据中寻找目标序列？ 已有1人参与

已有基因芯片数据，想从里面寻找到与拟南芥MAPKKK同源的基因序列。请问如何寻找？
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张楠楠的

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1楼 2015-05-04 19:21:30
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
需要知道你目的序列的探针，用探针去芯片里去找。目的序列的探针也可以通过用目的序列去BLAST你需要的探针库。
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2楼2015-05-04 19:51:01
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张楠楠的

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
谢谢你的回复！
不知道你描述的跟我理解的是不是一个意思（原谅我水平太low）。我所理解的是把拟南芥的基因序列和芯片数据的序列进行比对，然后找到同源性较高的基因芯片。但是基因芯片的序列好多有上万个，我是要挨个比对吗？有没有什么简洁快速的方法呢？
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3楼2015-05-05 10:23:39
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