24小时热门版块排行榜    

查看: 1474  |  回复: 9

棋水泱泱

新虫 (初入文坛)

[求助] 为什么我扩增3‘RACE出来三个片段,都有ploy A 结构 已有1人参与

最短的那条序列没有终止密码子,长的两个都有,长的两条蛋白序列前面都一样,只有最后20多个不一样,但是都有polyA结构,而且在NCBI上比对后都是我要的基因,请大神指点。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yingheqian

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-05-04 23:20:48
考虑一下mRNA的差异剪接,可能是由于剪接的方式不一样
2楼2015-05-04 10:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

棋水泱泱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yingheqian at 2015-05-04 10:29:16
考虑一下mRNA的差异剪接,可能是由于剪接的方式不一样

我也这样想过,那如果是剪接方式不一样,那是不是三个片段就没有什么意义了,直接用最长的那个就好。还是说写文章的时候要把这些写进去
3楼2015-05-04 10:41:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yingheqian

金虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 棋水泱泱 at 2015-05-04 10:41:33
我也这样想过,那如果是剪接方式不一样,那是不是三个片段就没有什么意义了,直接用最长的那个就好。还是说写文章的时候要把这些写进去...

如果是3种剪接方式,那么3种mRNA编码的蛋白有差异,并且其功能也有可能有差异,有可能是调控机制的一种,比较复杂了。要分析清楚,你和基因组比较一下,看看是不是其中几个外显子的差异组合或者。
4楼2015-05-04 10:57:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

棋水泱泱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yingheqian at 2015-05-04 10:57:57
如果是3种剪接方式,那么3种mRNA编码的蛋白有差异,并且其功能也有可能有差异,有可能是调控机制的一种,比较复杂了。要分析清楚,你和基因组比较一下,看看是不是其中几个外显子的差异组合或者。...

我现在还没有做基因的全长,只是cDNA的全长。我比对核酸序列,是第二个长的序列的中间比第一个长的少一段,所以所编码的蛋白最后二三十个氨基酸是不一样的。我想二三十氨基酸是不是不太长,所以功能也就没太大区别?但是应该是剪切方式不同造成的,因为是在中间少一段的。短的那个就没有终止子。那如果是调控机制的一种,我该怎么分析呀?因为这一块儿我不太懂,我们老师也不懂,所以麻烦你了。
5楼2015-05-04 11:07:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yingheqian

金虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 棋水泱泱 at 2015-05-04 11:07:10
我现在还没有做基因的全长,只是cDNA的全长。我比对核酸序列,是第二个长的序列的中间比第一个长的少一段,所以所编码的蛋白最后二三十个氨基酸是不一样的。我想二三十氨基酸是不是不太长,所以功能也就没太大区别 ...

我觉得你应该把3种全长都拿到,基因组序列也测出来,分析一下是不是可变剪接导致的。然后,可以逐个分析基因的功能,是调控还是这个基因本身就有3种功能蛋白。在你获得基本的信息之前,没有办法去下结论。如果整清楚了,说不定是一篇很好的文章
6楼2015-05-04 11:17:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

whh2013

金虫 (正式写手)

如果ORF区和你的一样,那就直接用最长的就好了。
7楼2015-05-04 19:52:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

混合配搭

新虫 (小有名气)

你好,你是怎么看有没有POLYA的啊?新手一枚
8楼2015-05-05 09:27:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

棋水泱泱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-05-05 09:27:58
你好,你是怎么看有没有POLYA的啊?新手一枚

poly A 结构就是序列3‘端尾部有一堆A碱基
9楼2015-05-05 12:36:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

棋水泱泱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by whh2013 at 2015-05-04 19:52:31
如果ORF区和你的一样,那就直接用最长的就好了。

但是最长的那个和第二长的ORF区蛋白有二三十个不一样呀,不知道这些不同有没有意义
10楼2015-05-05 12:38:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 棋水泱泱 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +23 医学老男孩 2026-08-13 49/2450 2026-08-14 20:02 by zhaifei
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +8 a089 2026-08-07 8/400 2026-08-14 18:46 by beefly
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-14 18:36 by 正能量1斤
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见