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36du

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】BSSE基组重叠误差校正,输入格式,分子说明部分

BSSE过程的输入看不懂啊,尤其是分子说明部分,要求的坐标和平时Gaussianview自动生成的坐标不一样啊,请高手指点,那坐标怎么生成,还有就是怎样把体系分成两部分考查结合能。
以下是手册上的例子,看不懂,请指教。

# MP2/6-31G Counterpoise=2 Opt

Counterpoise with Z-matrix

0,1,0,3,1,2
O,0.0,0.0,0.0,1         结构从这里开始
O,1,ROO,2
X,1,1.,2,X3O
H,1,RO1H,3,HOX3,2,90.,0,1
H,1,RO1H,3,HOX3,2,-90.,0,1
X,2,1.,1,52.5,3,180.,0
H,2,RO2H1,6,H7OX,1,180.,0,2
H,2,RO2H2,6,H8OX,1,0.,0,2

Z-矩阵变量...       
# MP2/6-31G Counterpoise=2 Opt

Counterpoise with Cartesian

0,1
1  0.00  0.00  0.92  1
9  0.17  0.00  2.73  2
1  0.77  0.00  3.43  2
9  0.00  0.00  0.00  1

# hf/lanl2dz counterpoise=2 nosymm opt test

HBr + HF, optimization with counterpoise correction using ECP basis

0 1
H   -0.046866  0.   0.586860   1
Br  -0.331864  0.  -0.801000   1
F    0.396755  0.   2.739275   2
H    0.584835  0.   3.641534   2
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lixiaona158

木虫 (著名写手)

自由人

把体系分成两个片段优化的几何和以一个整体优化的几何结构有什么区别吗?

用分成片段的形式优化的几何去计算吸收光谱会有什么不同吗?
4楼2008-07-06 09:13:56
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