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【求助】BSSE基组重叠误差校正，输入格式，分子说明部分
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BSSE过程的输入看不懂啊，尤其是分子说明部分，要求的坐标和平时Gaussianview自动生成的坐标不一样啊，请高手指点，那坐标怎么生成，还有就是怎样把体系分成两部分考查结合能。 以下是手册上的例子，看不懂，请指教。 # MP2/6-31G Counterpoise=2 Opt Counterpoise with Z-matrix 0,1,0,3,1,2 O,0.0,0.0,0.0,1 结构从这里开始 O,1,ROO,2 X,1,1.,2,X3O H,1,RO1H,3,HOX3,2,90.,0,1 H,1,RO1H,3,HOX3,2,-90.,0,1 X,2,1.,1,52.5,3,180.,0 H,2,RO2H1,6,H7OX,1,180.,0,2 H,2,RO2H2,6,H8OX,1,0.,0,2 Z-矩阵变量... # MP2/6-31G Counterpoise=2 Opt Counterpoise with Cartesian 0,1 1 0.00 0.00 0.92 1 9 0.17 0.00 2.73 2 1 0.77 0.00 3.43 2 9 0.00 0.00 0.00 1 # hf/lanl2dz counterpoise=2 nosymm opt test HBr + HF, optimization with counterpoise correction using ECP basis 0 1 H -0.046866 0. 0.586860 1 Br -0.331864 0. -0.801000 1 F 0.396755 0. 2.739275 2 H 0.584835 0. 3.641534 2 |
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2楼2008-07-05 09:49:31
yuhuobuku
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zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
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Counterpoise Method (CP),是一种估计BSSE的近似方法。 Counterpoise=2 是把体系分成两个片段的意思。 第一个例子： 0,1,0,3,1,2 这一行分别是片段一片段二和整体的电荷和自旋多重度 O,0.0,0.0,0.0,1 用CP计算BSSE时若用内坐标，第一个原子得用笛卡尔坐标 O,1,ROO,2 最后一个数字2，代表片段2。同理，数字1代表片段1 X,1,1.,2,X3O 虚原子不加入片段，所以最后没数字1和2 H,1,RO1H,3,HOX3,2,90.,0,1 H,1,RO1H,3,HOX3,2,-90.,0,1 X,2,1.,1,52.5,3,180.,0 H,2,RO2H1,6,H7OX,1,180.,0,2 H,2,RO2H2,6,H8OX,1,0.,0,2 第二个例子和第三个例子就是用笛卡尔坐标。坐标后的数字代表片段。 gv能否自动生成分层体系我不清楚，但是自动生成坐标后你自己分层就好了。 |
3楼2008-07-06 08:54:16
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8楼2008-07-07 12:57:51
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10楼2008-07-07 16:57:39
