24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zenghy

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 120.4
帖子: 124
在线: 10.9小时
虫号: 3774348
注册: 2015-03-30
专业: 微生物生理与生物化学

[求助] 微生物基因组打成片段，用什么方法好？

准备进行微生物基因组二代测序，需要自己建立文库，已经提取基因组DNA，需要将基因组打成片段，是用超声波还是酶切的方法好？倾向于后者，后者的话用什么酶比较好？

回复此楼

» 猜你喜欢

带资进组求博导收留已经有9人回复
求助大佬们，伤口沾上了乙腈已经有6人回复
26申博自荐已经有6人回复
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章已经有9人回复
A期刊撤稿已经有4人回复

1楼 2015-04-15 11:01:30

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zenghy

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 120.4
帖子: 124
在线: 10.9小时
虫号: 3774348
注册: 2015-03-30
专业: 微生物生理与生物化学

送红花一朵

引用回帖:

12楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2015-04-17 10:55:01
超声的条件主要取决于你的基因组或质粒的G+C含量和你所需片段的大小。一般来说如果你的基因组G+C含量在50%左右，80w*2sec*3次，间歇5秒，可让你得到5-15k的片段，若要减小片段长度，可增加超声时间（3sec）或次数（ ...

谢谢楼主啊，我的菌4Mb，GC含量56%，需要用miseq测序，它的读长是2x250bp。