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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gaussian计算频率时输出的hessian是那一部分啊
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xixi1007

木虫 (小有名气)

[求助] gaussian计算频率时输出的hessian是那一部分啊

我用水做一例子计算hessian矩阵。以下是输出文件中的一部分，但是不太清楚哪部分是。是最后的 Hessian after L703:后面的吗。是的话，水的话其hessian矩阵是9*9的吗，那么它上三角的内容是什么呢。还有下面出现的D是什么意思啊。是我们平常说的指数e吗？
Hessian from J:
                1             2             3             4             5
      1  0.000000D+00
      2  0.000000D+00  0.000000D+00
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      4  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.441362D+01
      5  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.948350D+00
      6  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      7  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.220681D+01  0.000000D+00
      8  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.474175D+00
      9  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.121877D+01
     10  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.220681D+01  0.000000D+00
     11  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.474175D+00
     12  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.121877D+01
                6             7             8             9            10
      6 -0.273959D+01
      7  0.000000D+00 -0.214794D+01
      8  0.121674D+01  0.000000D+00 -0.602963D+00
      9  0.136980D+01  0.000000D+00 -0.121776D+01 -0.129566D+01
     10  0.000000D+00 -0.588633D-01  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.214794D+01
     11 -0.121674D+01  0.000000D+00  0.128788D+00 -0.101712D-02  0.000000D+00
     12  0.136980D+01  0.000000D+00  0.101712D-02 -0.741375D-01  0.000000D+00
               11            12
     11 -0.602963D+00
     12  0.121776D+01 -0.129566D+01
Force constants from FoF:
                1             2             3             4             5
      1  0.000000D+00
      2  0.000000D+00  0.000000D+00
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      4  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.441362D+01
      5  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.948350D+00
      6  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      7  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.220681D+01  0.000000D+00
      8  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.474175D+00
      9  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.121877D+01
     10  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.220681D+01  0.000000D+00
     11  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.474175D+00
     12  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.121877D+01
                6             7             8             9            10
      6 -0.273959D+01
      7  0.000000D+00 -0.214794D+01
      8  0.121674D+01  0.000000D+00 -0.602963D+00
      9  0.136980D+01  0.000000D+00 -0.121776D+01 -0.129566D+01
     10  0.000000D+00 -0.588633D-01  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.214794D+01
     11 -0.121674D+01  0.000000D+00  0.128788D+00 -0.101712D-02  0.000000D+00
     12  0.136980D+01  0.000000D+00  0.101712D-02 -0.741375D-01  0.000000D+00
               11            12
     11 -0.602963D+00
     12  0.121776D+01 -0.129566D+01
Second derivatives from L703 IAtSt=0:
                1             2             3             4             5
      1  0.000000D+00
      2  0.000000D+00  0.000000D+00
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      4  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.441362D+01
      5  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.948350D+00
      6  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      7  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.220681D+01  0.000000D+00
      8  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.474175D+00
      9  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.121877D+01
     10  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.220681D+01  0.000000D+00
     11  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.474175D+00
     12  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.121877D+01
                6             7             8             9            10
      6 -0.273959D+01
      7  0.000000D+00 -0.214794D+01
      8  0.121674D+01  0.000000D+00 -0.602963D+00
      9  0.136980D+01  0.000000D+00 -0.121776D+01 -0.129566D+01
     10  0.000000D+00 -0.588633D-01  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.214794D+01
     11 -0.121674D+01  0.000000D+00  0.128788D+00 -0.101712D-02  0.000000D+00
     12  0.136980D+01  0.000000D+00  0.101712D-02 -0.741375D-01  0.000000D+00
               11            12
     11 -0.602963D+00
     12  0.121776D+01 -0.129566D+01
Polarizability into L703:
                1             2             3
      1  0.783222D+00
      2  0.000000D+00  0.680812D+01
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.362564D+01
Polarizability after L703:
                1             2             3
      1  0.783222D+00
      2  0.000000D+00  0.680812D+01
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.362564D+01
Dipole Derivatives into L703:
                 1             2             3             4             5
      1  -0.871467D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.435734D+00  0.000000D+00
      2   0.000000D+00 -0.387147D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.193574D+00
      3   0.000000D+00  0.000000D+00 -0.329661D+00  0.000000D+00  0.103814D+00
                 6             7             8             9
      1   0.000000D+00  0.435734D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      2   0.176832D+00  0.000000D+00  0.193574D+00 -0.176832D+00
      3   0.164831D+00  0.000000D+00 -0.103814D+00  0.164831D+00
Dipole Derivatives after L703:
                 1             2             3             4             5
      1  -0.871467D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.435734D+00  0.000000D+00
      2   0.000000D+00 -0.387147D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.193574D+00
      3   0.000000D+00  0.000000D+00 -0.329661D+00  0.000000D+00  0.103814D+00
                 6             7             8             9
      1   0.000000D+00  0.435734D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      2   0.176832D+00  0.000000D+00  0.193574D+00 -0.176832D+00
      3   0.164831D+00  0.000000D+00 -0.103814D+00  0.164831D+00
Hessian into L703:
                1             2             3             4             5
      1  0.441373D+01
      2  0.000000D+00  0.166319D+01
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.317440D+01
      4 -0.220687D+01  0.000000D+00  0.000000D+00  0.214806D+01
      5  0.000000D+00 -0.831595D+00 -0.103436D+01  0.000000D+00  0.997733D+00
      6  0.000000D+00 -0.957818D+00 -0.158720D+01  0.000000D+00  0.996090D+00
      7 -0.220687D+01  0.000000D+00  0.000000D+00  0.588069D-01  0.000000D+00
      8  0.000000D+00 -0.831595D+00  0.103436D+01  0.000000D+00 -0.166139D+00
      9  0.000000D+00  0.957818D+00 -0.158720D+01  0.000000D+00  0.382723D-01
                6             7             8             9
      6  0.149973D+01
      7  0.000000D+00  0.214806D+01
      8 -0.382723D-01  0.000000D+00  0.997733D+00
      9  0.874759D-01  0.000000D+00 -0.996090D+00  0.149973D+01
Hessian after L703:
                1             2             3             4             5
      1  0.117370D-03
      2  0.000000D+00  0.714839D+00
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.434810D+00
      4 -0.586851D-04  0.000000D+00  0.000000D+00  0.115086D-03
      5  0.000000D+00 -0.357419D+00  0.182376D+00  0.000000D+00  0.394771D+00
      6  0.000000D+00  0.260955D+00 -0.217405D+00  0.000000D+00 -0.221665D+00
      7 -0.586851D-04  0.000000D+00  0.000000D+00 -0.564006D-04  0.000000D+00
      8  0.000000D+00 -0.357419D+00 -0.182376D+00  0.000000D+00 -0.373513D-01
      9  0.000000D+00 -0.260955D+00 -0.217405D+00  0.000000D+00  0.392894D-01
                6             7             8             9
      6  0.204067D+00
      7  0.000000D+00  0.115086D-03
      8 -0.392894D-01  0.000000D+00  0.394771D+00
      9  0.133384D-01  0.000000D+00  0.221665D+00  0.204067D+00
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1楼 2015-04-09 14:49:42
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xixi1007

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by beefly at 2015-04-09 22:51:46
前面的Hessian是每个能量项分步叠加的结果。只有Hessian after L703之后才是频率计算用的总Hessian。

谢谢回复！输出的hessian矩阵是下三角的。上三角的内容是和小三角的内容对称的吗
赞一下 回复此楼
3楼2015-04-11 10:27:11
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查看全部 11 个回答

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-04-10 22:29:43
xixi1007: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢！ 2015-04-20 14:35:15
前面的Hessian是每个能量项分步叠加的结果。只有Hessian after L703之后才是频率计算用的总Hessian。
赞一下 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2015-04-09 22:51:46
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xixi1007: 金币+8, ★★★很有帮助 2015-04-15 13:48:34
引用回帖:
3楼: Originally posted by xixi1007 at 2015-04-11 10:27:11
谢谢回复！输出的hessian矩阵是下三角的。上三角的内容是和小三角的内容对称的吗...

应该是的。
水的hessian是9*9
hessian本身是对称的，所以输出一个三角的数据就够了。
赞一下 回复此楼
4楼2015-04-13 09:32:43
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xixi1007

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-13 09:32:43
应该是的。
水的hessian是9*9
hessian本身是对称的，所以输出一个三角的数据就够了。...

麻烦再问一下这个hessian矩阵就是the original Hessian matrix in the mass-weighted Cartesian coordinate system 吗
赞一下 回复此楼
5楼2015-04-15 15:09:16
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[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +3 工厂打螺丝 2026-08-08 3/150 2026-08-11 13:42 by 会议编辑
[基金申请] FileCode能看出啥？ +7 要乐观耀哥 2026-08-10 17/850 2026-08-11 10:50 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
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