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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求大神帮忙得到一个分析方法，拜托！拜托！！！
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白玉浴血

木虫 (正式写手)

[求助] 求大神帮忙得到一个分析方法，拜托！拜托！！！ 已有3人参与

我模拟的胶体，我想得到在z轴方向上体系内表面活性剂单体数目的分布情况，请问有人知道怎样可以得到这一结果呢？求大神帮忙！！！
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1楼 2015-04-08 10:58:49
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我是这样想的。把模型简化为二维，即z坐标不考虑，从体系中心开始，每一个r范围内计数，最终得到的就应该是你要的结果了吧
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2楼2015-04-08 11:28:28
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2015-04-09 07:21:24
concentration profile的功能可以得到沿某一方向上某种分子的浓度分布 不知道是不是你要的功能
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2015-04-08 16:29:17
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巧帅之风

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
法1，在z轴方向上分层；
法2，得到坐标文件用fortran编程统计。
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无冥冥之志者，无昭昭之明；无?�?钢抡撸藓蘸罩Α�
4楼2015-04-10 08:43:45
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白玉浴血

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-04-08 11:28:28
我是这样想的。把模型简化为二维，即z坐标不考虑，从体系中心开始，每一个r范围内计数，最终得到的就应该是你要的结果了吧

嗯，可以这样理解，但是应该怎样获得呢
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5楼2015-04-11 08:17:06
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白玉浴血

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 巧帅之风 at 2015-04-10 08:43:45
法1，在z轴方向上分层；
法2，得到坐标文件用fortran编程统计。

能否具体的告知第一种方法的做法吗？
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6楼2015-04-11 08:56:13
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白玉浴血

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2015-04-08 16:29:17
concentration profile的功能可以得到沿某一方向上某种分子的浓度分布 不知道是不是你要的功能

请问这是MS软件里的吗？具体的是什么模块呢？谢谢
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7楼2015-04-11 09:00:41
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abinitio

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 白玉浴血 at 2015-04-11 08:17:06
嗯，可以这样理解，但是应该怎样获得呢...

当然是自己写段小程序呀，否则你这种非标准要求，哪里找菜单去？

[ 发自小木虫客户端 ]
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8楼2015-04-11 15:25:07
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白玉浴血

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by abinitio at 2015-04-11 15:25:07
当然是自己写段小程序呀，否则你这种非标准要求，哪里找菜单去？
...

我在forcite analys 里面找到了相关的分布，这个可以使用吗？
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9楼2015-04-11 16:14:03
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
7楼: Originally posted by 白玉浴血 at 2015-04-11 09:00:41
请问这是MS软件里的吗？具体的是什么模块呢？谢谢...

forcite的分析模块可以做

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
10楼2015-04-12 08:17:58
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