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xcid

银虫 (小有名气)

[求助] 请问有没有人用Vasp算过声子,我们组里还没有人会跑,各位大神,拜托,拜托

我们老师叫我和师姐到vasp主页上去看phonony,并要求知道怎么算,因为我们老师以前都没有算过。向各位用过vasp算过声子的大神求教,谢谢了!
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小菜一碟
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by tt-0-8 at 2012-10-31 09:31:52
安装numpy所提示错误:
Traceback (most recent call last):
  File "setup.py", line 3, in <module>
    import numpy
  File "/root/Desktop/phonopy-1.2.1/numpy/__init__.py", ...

BLAS和LAPACK库没有装,先用yum装上
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
12楼2012-10-31 10:24:26
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普通回帖

iamikaruk

木虫 (著名写手)

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流, 2012-10-29 22:26:36
(1)用phonopy生成单胞加倍的POSCAR-XXX
(2)用VASP做静态自洽计算,得到对应于不同POSCAR-XXX的vasprun.xml
(3)用phonopy将所有的vasprun.xml结果汇总得到力常数矩阵以及声子色散关系
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
2楼2012-10-29 21:00:42
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xcid

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-10-29 21:00:42
(1)用phonopy生成单胞加倍的POSCAR-XXX
(2)用VASP做静态自洽计算,得到对应于不同POSCAR-XXX的vasprun.xml
(3)用phonopy将所有的vasprun.xml结果汇总得到力常数矩阵以及声子色散关系

我在vasp主页上下载了phonoy软件压缩包,只有几M,在linux系统下解压缩了,是不是就可以用了?
小菜一碟
3楼2012-10-30 16:51:24
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xcid at 2012-10-30 16:51:24
我在vasp主页上下载了phonoy软件压缩包,只有几M,在linux系统下解压缩了,是不是就可以用了?...

vasp主页上有phonopy么?
需要用python编译
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
4楼2012-10-30 17:04:28
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tt-0-8

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-10-30 17:04:28
vasp主页上有phonopy么?
需要用python编译...

之前想安装phonopy程序,但是总是有这样那样的问题,有没有简洁系统的安装方法
坚持就是胜利,哈哈
5楼2012-10-30 19:07:50
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xcid

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-10-30 17:04:28
vasp主页上有phonopy么?
需要用python编译...

我看过了,只有几个例子介绍。那个程序是不是要买啊?
小菜一碟
6楼2012-10-30 19:15:53
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by tt-0-8 at 2012-10-30 19:07:50
之前想安装phonopy程序,但是总是有这样那样的问题,有没有简洁系统的安装方法...

我觉得phonopy的编译已经比较简单了,你遇到的问题是?
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
7楼2012-10-30 22:13:40
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xcid at 2012-10-30 19:15:53
我看过了,只有几个例子介绍。那个程序是不是要买啊?...

免费的
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
8楼2012-10-30 22:13:51
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tt-0-8

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-10-30 22:13:40
我觉得phonopy的编译已经比较简单了,你遇到的问题是?...

首先如果用原程序安装,我记得需要改很多东西,而我对这个东西又不在行,不知道哪些该改哪些不用改,貌似Ubuntu系统比较好装,但我用的是suse,网上的提示大都是针对Ubuntu系统,我按照提示来改总是会遇到问题
如果用虚拟的来安装又有几个必须的相关小的数据库找不到,总是卡在这些地方
坚持就是胜利,哈哈
9楼2012-10-31 09:21:04
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by tt-0-8 at 2012-10-31 09:21:04
首先如果用原程序安装,我记得需要改很多东西,而我对这个东西又不在行,不知道哪些该改哪些不用改,貌似Ubuntu系统比较好装,但我用的是suse,网上的提示大都是针对Ubuntu系统,我按照提示来改总是会遇到问题
如 ...

基本上不需要修改什么吧?ubuntu的确是比较好装一点,不过suse只要有那几个库,应该也是没有问题的。
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
10楼2012-10-31 09:22:50
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