24小时热门版块排行榜    

查看: 2988  |  回复: 12

molx79

新虫 (初入文坛)

[求助] Gamess如何读取赝势基组的自定义$ECP部分 已有1人参与

本人才学疏浅,求各位老师、大师不吝赐教。我做的体系:SI2....HCHO的能量分解。其中I原子选取的基组是aug-cc-pvtz-pp,其余的原子选用的基组是aug-cc-pvtz。如果I原子选用系统自带的SBKJC就能算成:
$ECP
I-ECP SBKJC
I-ECP SBKJC                    
O-ecp none                                   
S-ecp none
C-ecp none                                   
H-ecp none
H-ecp none
$END     。

由于我高斯计算的I采用aug-cc-pvtz-pp。所以我把网页的https://bse.pnl.gov/bse/portal查到的I的:
I-ECP GEN     28     4  1      ----- g-ul potential     -----      0.00000000       2      1.00000000        
3      ----- s-ul potential     -----     
49.98964900       2     40.03337600           
281.00655600       2     17.30057600            
61.41673900       2      8.85172000        
4      ----- p-ul potential     -----   
67.41623900       2     15.72014100           
134.80769600      2     15.20822200            
14.56654800       2      8.29418600            
28.96842200       2      7.75394900         
4      ----- d-ul potential     -----     
35.53875600       2     13.81775100            
53.33975900       2     13.58780500            
9.71646600       2      6.94763000            
14.97750000       2      6.96009900         
4      ----- f-ul potential     -----   
-20.17661800       2     18.52295000           
-26.08807700       2     18.25103500           
-0.22043400       2   7.55790100            
-0.22164600       2      7.59740400      
按照gamess说明书的内容,改为:
I-ECP GEN     28     4  
1 ----- IODINE U(g) -----   
0.00000000       2      1.00000000        
3      ----- IODINE U(s)-u(g)    -----   
49.98964900      2     40.03337600         
281.00655600      2     17.30057600           
61.41673900      2      8.85172000         
4      ----- IODINE U(p)-u(g)     -----  
67.41623900       2     15.72014100         
134.80769600       2     15.20822200         
14.56654800       2      8.29418600           
28.96842200       2      7.75394900         
4      ----- IODINE U(d)-u(g)     -----   
35.53875600       2     13.81775100         
53.33975900       2     13.58780500         
9.71646600       2      6.94763000         
14.97750000       2      6.96009900         
4      ----- IODINE U(f)-u(g)     -----   
-20.17661800       2     18.52295000         
-26.08807700       2     18.25103500         
-0.22043400       2      7.55790100         
-0.22164600       2      7.59740400   
但是Games读取不了,给的错误是
**** ERROR READING VARIABLE IZCORE   CHECK COLUMN 16   1      ----- IODINE U(g)     -----                                             ....V....1....V....2....V....3....V....4....V....5....V....6....V....7....V....8 EXECUTION OF GAMESS TERMINATED -ABNORMALLY- AT Fri Apr  3 08:40:01 2015                580000  WORDS OF DYNAMIC MEMORY USED请大家不吝赐教,拜托
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

能量分解

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

小范范1989

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我不用gamess,也不会用,但是我见过一个帖子很好,我就收藏了,拿出来和楼主分享一下,希望能有帮助。
http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=745
原创,应该很实用。
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2015-04-03 20:15:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

那个网页上有gamess格式的ecp,为什么不用?
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2015-04-03 20:18:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

molx79

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by beefly at 2015-04-03 20:18:26
那个网页上有gamess格式的ecp,为什么不用?

直接用读不了,所以才想办法修改,但是修改后也读不了
4楼2015-04-03 21:04:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molx79

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-03 20:15:56
我不用gamess,也不会用,但是我见过一个帖子很好,我就收藏了,拿出来和楼主分享一下,希望能有帮助。
http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=745
原创,应该很实用。

这个问题,我请教过你收藏帖子的发帖人,也是没解决。但对您的热心帮助表示感谢
5楼2015-04-03 21:05:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

引用回帖:
4楼: Originally posted by molx79 at 2015-04-03 21:04:36
直接用读不了,所以才想办法修改,但是修改后也读不了...

原来的基组除了缺少换行以外没有其它问题。改了之后的完全错了
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
6楼2015-04-04 00:26:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molx79

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by beefly at 2015-04-04 00:26:55
原来的基组除了缺少换行以外没有其它问题。改了之后的完全错了...

您的意思是我直接复制网页的机组的ECP部分,格式不变,对吗,我马上试一下。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2015-04-04 06:44:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molx79

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by beefly at 2015-04-04 00:26:55
原来的基组除了缺少换行以外没有其它问题。改了之后的完全错了...

$ECP
I-ECP GEN     28     4
  1      ----- g-ul potential     -----
      0.00000000       2      1.00000000      
  3      ----- s-ul potential     -----
     49.98964900       2     40.03337600      
    281.00655600       2     17.30057600      
     61.41673900       2      8.85172000      
  4      ----- p-ul potential     -----
     67.41623900       2     15.72014100      
    134.80769600       2     15.20822200      
     14.56654800       2      8.29418600      
     28.96842200       2      7.75394900      
  4      ----- d-ul potential     -----
     35.53875600       2     13.81775100      
     53.33975900       2     13.58780500      
      9.71646600       2      6.94763000      
     14.97750000       2      6.96009900      
  4      ----- f-ul potential     -----
    -20.17661800       2     18.52295000      
    -26.08807700       2     18.25103500      
     -0.22043400       2      7.55790100      
     -0.22164600       2      7.59740400      
I-ECP GEN     28     4
  1      ----- g-ul potential     -----
      0.00000000       2      1.00000000      
  3      ----- s-ul potential     -----
     49.98964900       2     40.03337600      
    281.00655600       2     17.30057600      
     61.41673900       2      8.85172000      
  4      ----- p-ul potential     -----
     67.41623900       2     15.72014100      
    134.80769600       2     15.20822200      
     14.56654800       2      8.29418600      
     28.96842200       2      7.75394900      
  4      ----- d-ul potential     -----
     35.53875600       2     13.81775100      
     53.33975900       2     13.58780500      
      9.71646600       2      6.94763000      
     14.97750000       2      6.96009900      
  4      ----- f-ul potential     -----
    -20.17661800       2     18.52295000      
    -26.08807700       2     18.25103500      
     -0.22043400       2      7.55790100      
     -0.22164600       2      7.59740400      
O-ecp none                                   
S-ecp none
C-ecp none                                   
H-ecp none
H-ecp none
$END      
这是我的输入文件的格式,还是读不了
8楼2015-04-04 07:09:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★ ★ ★ ★
molx79(zhou2009代发): 金币+5 2015-04-04 15:07:24
引用回帖:
8楼: Originally posted by molx79 at 2015-04-04 07:09:26
$ECP
I-ECP GEN     28     4
  1      ----- g-ul potential     -----
      0.00000000       2      1.00000000      
  3      ----- s-ul potential     -----
     49.98964900       2     40.0333 ...

每种元素的ECP只能定义一次。第二个I原子的ECP要写成:
I-ECP
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
9楼2015-04-04 12:48:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molx79

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by beefly at 2015-04-04 12:48:43
每种元素的ECP只能定义一次。第二个I原子的ECP要写成:
I-ECP...

您太神了,目前还没死,应该是读过基组信息了。对您顶礼膜拜。
10楼2015-04-04 13:28:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 molx79 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 3/150 2026-08-26 00:40 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +16 木水思豆 2026-08-25 19/950 2026-08-25 23:56 by dragonxp
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见