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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gamess/Q-Chem » Gamess如何读取赝势基组的自定义$ECP部分
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molx79

新虫 (初入文坛)

[求助] Gamess如何读取赝势基组的自定义$ECP部分已有1人参与

本人才学疏浅，求各位老师、大师不吝赐教。我做的体系：SI2....HCHO的能量分解。其中Ｉ原子选取的基组是ａｕｇ－ｃｃ－ｐｖｔｚ－ｐｐ，其余的原子选用的基组是ａｕｇ－ｃｃ－ｐｖｔｚ。如果Ｉ原子选用系统自带的SBKJC就能算成：
$ECP
I-ECP SBKJC
I-ECP SBKJC                    
O-ecp none                                   
S-ecp none
C-ecp none                                   
H-ecp none
H-ecp none
$END     。

由于我高斯计算的Ｉ采用ａｕｇ－ｃｃ－ｐｖｔｚ－ｐｐ。所以我把网页的https://bse.pnl.gov/bse/portal查到的Ｉ的：
I-ECP GEN     28     4  1      ----- g-ul potential     -----      0.00000000       2      1.00000000        
3      ----- s-ul potential     -----     
49.98964900       2     40.03337600           
281.00655600       2     17.30057600            
61.41673900       2      8.85172000        
4      ----- p-ul potential     -----   
67.41623900       2     15.72014100           
134.80769600      2     15.20822200            
14.56654800       2      8.29418600            
28.96842200       2      7.75394900         
4      ----- d-ul potential     -----     
35.53875600       2     13.81775100            
53.33975900       2     13.58780500            
9.71646600       2      6.94763000            
14.97750000       2      6.96009900         
4      ----- f-ul potential     -----   
-20.17661800       2     18.52295000           
-26.08807700       2     18.25103500           
-0.22043400       2 　　7.55790100            
-0.22164600       2      7.59740400      
按照ｇａｍｅｓｓ说明书的内容，改为：
I-ECP GEN     28     4  
1 ----- IODINE U(g) -----   
0.00000000       2      1.00000000        
3      ----- IODINE U(s)-u(g)    -----   
49.98964900      2     40.03337600         
281.00655600      2     17.30057600           
61.41673900      2      8.85172000         
4      ----- IODINE U(p)-u(g)     -----  
67.41623900       2     15.72014100         
134.80769600       2     15.20822200         
14.56654800       2      8.29418600           
28.96842200       2      7.75394900         
4      ----- IODINE U(d)-u(g)     -----   
35.53875600       2     13.81775100         
53.33975900       2     13.58780500         
9.71646600       2      6.94763000         
14.97750000       2      6.96009900         
4      ----- IODINE U(f)-u(g)     -----   
-20.17661800       2     18.52295000         
-26.08807700       2     18.25103500         
-0.22043400       2      7.55790100         
-0.22164600       2      7.59740400   
但是Ｇａｍｅｓ读取不了，给的错误是
**** ERROR READING VARIABLE IZCORE   CHECK COLUMN 16   1      ----- IODINE U(g)     -----                                             ....V....1....V....2....V....3....V....4....V....5....V....6....V....7....V....8 EXECUTION OF GAMESS TERMINATED -ABNORMALLY- AT Fri Apr  3 08:40:01 2015                580000  WORDS OF DYNAMIC MEMORY USED请大家不吝赐教，拜托
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1楼2015-04-03 19:04:39
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

小范范1989

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我不用gamess，也不会用，但是我见过一个帖子很好，我就收藏了，拿出来和楼主分享一下，希望能有帮助。
http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=745
原创，应该很实用。
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2015-04-03 20:15:56
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
那个网页上有gamess格式的ecp，为什么不用？
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2015-04-03 20:18:26
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普通回帖

molx79

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by beefly at 2015-04-03 20:18:26
那个网页上有gamess格式的ecp，为什么不用？

直接用读不了，所以才想办法修改，但是修改后也读不了
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4楼2015-04-03 21:04:36
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molx79

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-03 20:15:56
我不用gamess，也不会用，但是我见过一个帖子很好，我就收藏了，拿出来和楼主分享一下，希望能有帮助。
http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=745
原创，应该很实用。

这个问题，我请教过你收藏帖子的发帖人，也是没解决。但对您的热心帮助表示感谢
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5楼2015-04-03 21:05:48
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
引用回帖:
4楼: Originally posted by molx79 at 2015-04-03 21:04:36
直接用读不了，所以才想办法修改，但是修改后也读不了...

原来的基组除了缺少换行以外没有其它问题。改了之后的完全错了
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
6楼2015-04-04 00:26:55
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molx79

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by beefly at 2015-04-04 00:26:55
原来的基组除了缺少换行以外没有其它问题。改了之后的完全错了...

您的意思是我直接复制网页的机组的ECP部分，格式不变，对吗，我马上试一下。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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7楼2015-04-04 06:44:17
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molx79

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by beefly at 2015-04-04 00:26:55
原来的基组除了缺少换行以外没有其它问题。改了之后的完全错了...

$ECP
I-ECP GEN     28     4
  1      ----- g-ul potential     -----
      0.00000000       2      1.00000000      
  3      ----- s-ul potential     -----
     49.98964900       2     40.03337600      
    281.00655600       2     17.30057600      
     61.41673900       2      8.85172000      
  4      ----- p-ul potential     -----
     67.41623900       2     15.72014100      
    134.80769600       2     15.20822200      
     14.56654800       2      8.29418600      
     28.96842200       2      7.75394900      
  4      ----- d-ul potential     -----
     35.53875600       2     13.81775100      
     53.33975900       2     13.58780500      
      9.71646600       2      6.94763000      
     14.97750000       2      6.96009900      
  4      ----- f-ul potential     -----
    -20.17661800       2     18.52295000      
    -26.08807700       2     18.25103500      
     -0.22043400       2      7.55790100      
     -0.22164600       2      7.59740400      
I-ECP GEN     28     4
  1      ----- g-ul potential     -----
      0.00000000       2      1.00000000      
  3      ----- s-ul potential     -----
     49.98964900       2     40.03337600      
    281.00655600       2     17.30057600      
     61.41673900       2      8.85172000      
  4      ----- p-ul potential     -----
     67.41623900       2     15.72014100      
    134.80769600       2     15.20822200      
     14.56654800       2      8.29418600      
     28.96842200       2      7.75394900      
  4      ----- d-ul potential     -----
     35.53875600       2     13.81775100      
     53.33975900       2     13.58780500      
      9.71646600       2      6.94763000      
     14.97750000       2      6.96009900      
  4      ----- f-ul potential     -----
    -20.17661800       2     18.52295000      
    -26.08807700       2     18.25103500      
     -0.22043400       2      7.55790100      
     -0.22164600       2      7.59740400      
O-ecp none                                   
S-ecp none
C-ecp none                                   
H-ecp none
H-ecp none
$END      
这是我的输入文件的格式，还是读不了
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8楼2015-04-04 07:09:26
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★ ★ ★ ★
molx79(zhou2009代发): 金币+5 2015-04-04 15:07:24
引用回帖:
8楼: Originally posted by molx79 at 2015-04-04 07:09:26
$ECP
I-ECP GEN     28     4
  1      ----- g-ul potential     -----
      0.00000000       2      1.00000000      
  3      ----- s-ul potential     -----
     49.98964900       2     40.0333 ...

每种元素的ECP只能定义一次。第二个I原子的ECP要写成：
I-ECP
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
9楼2015-04-04 12:48:43
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molx79

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by beefly at 2015-04-04 12:48:43
每种元素的ECP只能定义一次。第二个I原子的ECP要写成：
I-ECP...

您太神了，目前还没死，应该是读过基组信息了。对您顶礼膜拜。
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10楼2015-04-04 13:28:43
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