24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 493  |  回复: 4
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 zc210 的 6 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zc210

新虫 (正式写手)

[交流] 请教氢键问题

晶体投稿回复说,platon 显示我化合物结构含有8个氢键,并且要求我用表格列出氢键。我的化合物是用SHELXTL 精修的(别人做的),并没有发现氢键,现在说有氢键,我应该怎么做?需要重新精修的吗?用 platon 来精修吗? 怎么用 platon 精修找出氢键? 我对platon 不熟悉,希望大家指点。不胜感激!!!!!!!!!!!!!
回复此楼
曾因醉酒鞭名马,最怕情多累美人!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

limingtiaan2

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
zc210(金币+2,VIP+0):谢谢指点
除了楼上讲的原因之外,还有种可能是,氢键全部为非经典的氢键,比如C-H...O等,那样也是不出现在CIF里的,要是自己补充的,编辑方法如上!
永远有多远?没有答案,海枯石烂!
4楼2008-06-29 19:18:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

gujm516

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
zc210(金币+5,VIP+0):非常感谢,我先试试!
用Mercury软件(在http://www.ccdc.cam.ac.uk免费服务栏可下载)打开CIF文件,复选氢键或短接触框,可以看到氢键或短接触。
   
      用右上方的测量工具测量这些氢键(或短接触)的键长和键角并记下。

      自己编一段氢键列表,如下格式:
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
  O51 H51 O34  0.84 2.25   3.005(18)  150      .     n
  N1  H1B O23  0.92 1.85   2.760(11)  172  1_445 y
2楼2008-06-29 15:58:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★
zc210(金币+2,VIP+0):谢谢!
你的ins文件有没有加上HTAB啊  没有的话就不会出来氢键的
好像platon也会给出氢键的啊
3楼2008-06-29 16:27:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yejun4321

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gujm516 at 2008-6-29 15:58:
用Mercury软件(在http://www.ccdc.cam.ac.uk免费服务栏可下载)打开CIF文件,复选氢键或短接触框,可以看到氢键或短接触。
   
      用右上方的测量工具测量这些氢键(或短接触)的键长和键角并记 ...

自己测量然后编的? 你真强大
5楼2008-06-30 00:34:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 285求调剂 +9 柴郡猫_ 2026-04-09 9/450 2026-04-09 18:58 by 探123
[考研] 269电子信息求调剂,可转专业 +6 独酌wl 2026-04-06 6/300 2026-04-09 17:33 by wp06
[考研] 265求调剂 +4 风说她早忘了 2026-04-07 4/200 2026-04-09 13:59 by only周
[考研] 283电子信息求调剂 +4 三石WL 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:21 by wp06
[考研] 招收有机化学、化工,药学,食品灯专业学生 +3 yrfhjgdj 2026-04-08 3/150 2026-04-09 10:15 by QYQX_123
[考研] 0703调剂 +17 拾玖壹 2026-04-04 19/950 2026-04-09 09:18 by may_新宇
[考研] 一志愿华东理工085601材料工程303分求调剂 +15 a1708 2026-04-06 15/750 2026-04-08 16:23 by luoyongfeng
[考研] 284求调剂 +17 梵@@ 2026-04-06 17/850 2026-04-08 11:35 by 1shin_ichi
[考研] 22408 266求调剂 +11 masss11222 2026-04-07 14/700 2026-04-08 11:06 by yulian1987
[考研] 农学,求调剂,314分 +4 访客记录可爱 2026-04-04 4/200 2026-04-07 21:07 by 等岸
[考研] 求调剂 +5 小沢 2026-04-03 5/250 2026-04-06 22:45 by 875465
[考研] 材料专硕283求调剂 +17 试试看呗 2026-04-04 18/900 2026-04-06 09:24 by 286640313
[考研] 295求调剂 +8 FZAC123 2026-04-03 8/400 2026-04-05 17:46 by 蓝云思雨
[考研] 调剂 +8 熊二想上岸 2026-04-04 8/400 2026-04-05 05:27 by houyaoxu
[考研] 材料与化工306分找调剂 +12 沧海轻舟e 2026-04-03 13/650 2026-04-04 23:45 by lqwchd
[考研] 368求调剂 +5 今华习 2026-04-03 7/350 2026-04-04 18:47 by imissbao
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
[考研] 085701求调剂 +7 龚禹铭 2026-04-04 8/400 2026-04-04 13:49 by 小小树2024
[考研] 求调剂 +4 压力??大 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:36 by 啵啵啵0119
[考研] 286求调剂 +8 lim0922 2026-04-02 8/400 2026-04-03 20:19 by rzh123456
信息提示
请填处理意见