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[交流]
请教氢键问题
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| 晶体投稿回复说,platon 显示我化合物结构含有8个氢键,并且要求我用表格列出氢键。我的化合物是用SHELXTL 精修的(别人做的),并没有发现氢键,现在说有氢键,我应该怎么做?需要重新精修的吗?用 platon 来精修吗? 怎么用 platon 精修找出氢键? 我对platon 不熟悉,希望大家指点。不胜感激!!!!!!!!!!!!! |
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zc210(金币+5,VIP+0):非常感谢,我先试试!
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用Mercury软件(在http://www.ccdc.cam.ac.uk免费服务栏可下载)打开CIF文件,复选氢键或短接触框,可以看到氢键或短接触。 用右上方的测量工具测量这些氢键(或短接触)的键长和键角并记下。 自己编一段氢键列表,如下格式: loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_A _geom_hbond_publ_flag O51 H51 O34 0.84 2.25 3.005(18) 150 . n N1 H1B O23 0.92 1.85 2.760(11) 172 1_445 y |
2楼2008-06-29 15:58:13
huahua1216
至尊木虫 (文坛精英)
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3楼2008-06-29 16:27:31
limingtiaan2
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4楼2008-06-29 19:18:35
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