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fcff123

新虫 (初入文坛)

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[求助] 系统发育树已有6人参与

各位同仁大家好：
本人本科时学园林，研究生突然转战内生菌，现在建一个系统发育树，可是做出来有点怪，用DNAman做的，可是分支不明显，bootstrap 10000次，是不是我选择的同源性的序列有问题，现在急着分析，希望大家帮我看看问题出在什么地方了，小女子不胜感激！

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1楼 2015-03-31 10:33:28

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123q明

金虫 (小有名气)

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专业: 兽医传染病学

引用回帖:

3楼: Originally posted by gnot_nail at 2015-03-31 16:21:14
你这附图太小了吧，不好看出啥。。。bootstrap replication 1000就够了，不过这个应该影响不大，分支不明显除了和序列的选择有关，也和你建树的方法有一点相关，可以尝试用不同的算法建树，序列的选择可以选择和它相 ...

你好！我现在遇到一个问题，就是我的序列在NCBI，blast后下载相似度较高的序列，用mega做进化树，但是我的菌与其他菌亲缘性很低，数字都是0,2，不知道到底什么原因？你知道什么原因吗？

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