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jyddx2008

木虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
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在线: 326.3小时
虫号: 752341
注册: 2009-04-19
性别: GG
专业: 园艺作物采后生物学

[交流] 手头只有基因组DNA信息，如何寻找其中感兴趣的同源基因？已有2人参与

弱弱的请教，目前手头只有全基因组DNA信息，如何寻找其中感兴趣的同源基因？好像大多都是以其他物种中通过氨基酸同源性比对获得，直接用该物种基因的DNA序列去BLAST不可以啊？有多大差别啊？还是一定要将手头这个DNA序列转换成氨基酸序列呢。请教列位同仁，先谢谢了！

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1楼 2015-03-26 15:11:06

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growlywolf

金虫 (小有名气)

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专业: 生物信息学

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2015-03-28 16:24:25

用DNA序列做blast当然没有问题，而且只有这样你才能发现同义突变和移码突变啊

2楼2015-03-28 10:39:59

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digitalbio

新虫 (初入文坛)

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专业: 植物生理与生化

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

用你的基因组序列做库，搜集同源基因在库里blast试试。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

3楼2015-03-29 07:02:56

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