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手头只有基因组DNA信息,如何寻找其中感兴趣的同源基因?
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jyddx2008
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专业: 园艺作物采后生物学
[交流]
手头只有基因组DNA信息,如何寻找其中感兴趣的同源基因?
已有2人参与
弱弱的请教,目前手头只有全基因组DNA信息,如何寻找其中感兴趣的同源基因?好像大多都是以其他物种中通过氨基酸同源性比对获得,直接用该物种基因的DNA序列去BLAST不可以啊?有多大差别啊?还是一定要将手头这个DNA序列转换成氨基酸序列呢。请教列位同仁,先谢谢了!
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2015-03-26 15:11:06
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growlywolf
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专业: 生物信息学
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2015-03-28 16:24:25
用DNA序列做blast当然没有问题,而且只有这样你才能发现同义突变和移码突变啊
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2楼
2015-03-28 10:39:59
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digitalbio
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虫号: 3608543
注册: 2014-12-23
专业: 植物生理与生化
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用你的基因组序列做库,搜集同源基因在库里blast试试。
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼
2015-03-29 07:02:56
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