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对天空说lrj

金虫 (正式写手)

[求助] VMD怎么读取data文件? 已有5人参与

为了验证自己写的data文件对不对,我想用VMD导入data文件看看,但是不晓得怎么读取?求指点
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我若盛开,蝴蝶自来
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by li_xue_song at 2016-03-31 20:20:35
我想看看data.meam的结构,但是在VMD里面不知道怎么看,所以我run 了之后,看初始构型。这是个笨方法,具体我也不知道怎么弄可以直接导入查看。楼主知道后可以告诉我下。

若是lammps read_data的文件格式,可以用 topo readlammpsdata data.mean full打开。

注意,这里的full可以改成atomic,molecular, angle等,取决于你的atom_style。
13楼2016-04-02 01:04:56
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
https://sites.google.com/site/akohlmey/software/topotools
看里面的例子。

topo readlammpsdata *.data
2楼2015-03-25 10:53:10
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WanderingHeart

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2015-03-25 03:53:10
https://sites.google.com/site/akohlmey/software/topotools
看里面的例子。

topo readlammpsdata *.data

google sites访问不了啊~
3楼2015-03-25 11:37:06
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对天空说lrj

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2015-03-25 10:53:10
https://sites.google.com/site/akohlmey/software/topotools
看里面的例子。

topo readlammpsdata *.data

链接打不开,想问直接在VMD里面输入这个命令并不好用提示打不开,输入这个命令之前是否先导入你什么的?或者要操作一些什么呢?
我若盛开,蝴蝶自来
4楼2015-03-25 13:20:11
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