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Avrilyangty

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样从XRD(粉末)数据计算原子站位,已知晶系,求大神解惑!! 已有2人参与

如题,想在MS中建模做计算,但是在findit中找到的数据建模过程中会提示原子占位重合。。。
听老师说可以从XRD数据解出结构,无奈只会用公式算出b1b2b3之类的东西,算不出原子站位得不到结构模型。
样品为三硫化二铟纳米粉末,已知晶系,想得出原子占位,望各路大神不吝赐教!
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sgyin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个cif结构文件中原子占位SOF为分数(0.6667。。。),MS是不支持SOF 为分数的
<ahref="http://www.TickerFactory.com/"><imgborder="0"src=&am
7楼2015-03-20 22:49:50
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zbdfwq5777

木虫之王 (文学泰斗)

至尊山羊

文献杰出贡献

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
三氧化二铟作为已知物质,在晶体结构数据库里面是有原子位置参数等结构信息的。
利用XRD数据,跟数据库中In2O3的结构进行对比、精修,可以知道结构数据。
2楼2015-03-19 00:18:56
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Avrilyangty

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zbdfwq5777 at 2015-03-19 00:18:56
三氧化二铟作为已知物质,在晶体结构数据库里面是有原子位置参数等结构信息的。
利用XRD数据,跟数据库中In2O3的结构进行对比、精修,可以知道结构数据。

在findit数据库中确实是有这个数据,但是把对应我们结构的那个数据导入MS中建模时会出现提示原子占位重合,如果用这个模型模拟计算会有问题。所以现在就是想从我们的XRD 数据解出结构,再导入MS中建模。。。不知道用什么方法来做这个事情。。
3楼2015-03-19 10:16:24
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zbdfwq5777

木虫之王 (文学泰斗)

至尊山羊

文献杰出贡献

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by Avrilyangty at 2015-03-19 10:16:24
在findit数据库中确实是有这个数据,但是把对应我们结构的那个数据导入MS中建模时会出现提示原子占位重合,如果用这个模型模拟计算会有问题。所以现在就是想从我们的XRD 数据解出结构,再导入MS中建模。。。不知道 ...

你用的是In2O3的哪个结构?数据库里有几种。
4楼2015-03-19 10:22:11
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Avrilyangty

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zbdfwq5777 at 2015-03-19 10:22:11
你用的是In2O3的哪个结构?数据库里有几种。...

数据库中有四方,六方,但立方的就一个,ICSD #202353,Space Group: F d -3 m Z
SG Number: 227,Cryst Sys:   cubic
5楼2015-03-19 11:01:12
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Avrilyangty

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zbdfwq5777 at 2015-03-19 10:22:11
你用的是In2O3的哪个结构?数据库里有几种。...

Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)   
In   1  +3    8 a   0.125       0.125       0.125          0.6667     0         0.95(6)
In   2  +3    16 d  0.5         0.5         0.5            0.6667     0         1.41(4)
S    1  -2    32 e  0.2576(1)   0.2576(1)   0.2576(1)      0.75       0         0.76(9)
*end for    ICSD #202353
这个是卡里的那个院子站位
6楼2015-03-19 11:05:07
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Avrilyangty

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by sgyin at 2015-03-20 22:49:50
这个cif结构文件中原子占位SOF为分数(0.6667。。。),MS是不支持SOF 为分数的

啊,原来是这样!那有什么解决办法么???
8楼2015-03-21 12:32:16
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sgyin

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by Avrilyangty at 2015-03-21 12:32:16
啊,原来是这样!那有什么解决办法么???...

修改结构参数!
<ahref="http://www.TickerFactory.com/"><imgborder="0"src=&am
9楼2015-03-21 21:20:13
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Avrilyangty

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by sgyin at 2015-03-21 21:20:13
修改结构参数!...

是修改原子占位的值么???
10楼2015-03-23 09:38:35
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