应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 看文献手贱，自己动手算了下，发现结果不一样
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1171  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

建章宫细作

新虫 (初入文坛)

[交流] 看文献手贱，自己动手算了下，发现结果不一样

看到文献中说大豆叶绿体的AT含量高于别的植物的叶绿体，为66%，手贱，动手算了下，算出来为64.6%有木有。只是将ncbi上的序列下载下来，用grep统计了下。最近神经衰弱，总认为自己错了，要不就是序列下错了，要不就是grep用错了，总之，求帮忙核算一下。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2015-03-11 12:36:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shcj

铁杆木虫 (文坛精英)
★
建章宫细作(金币+5): 谢谢参与
祝福楼主！
回复此楼
4楼2015-03-11 13:12:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

707607008

新虫 (小有名气)
★
建章宫细作(金币+5): 谢谢参与
这比较正常，因为算法过程不一样，文献中的数据可能是经过多个数据综合来算的，而你算的只是文献中给出的某两个平均后数据，所以会出现这种误差。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
2楼2015-03-11 12:41:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

建章宫细作

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 707607008 at 2015-03-11 12:41:02
这比较正常，因为算法过程不一样，文献中的数据可能是经过多个数据综合来算的，而你算的只是文献中给出的某两个平均后数据，所以会出现这种误差。

不太可能是算法过程不一样，首先，叶绿体只有152k  （152 218），因为用的一代测序，所以，没有N，ATCG都是明确的，其次，那篇文章似乎就是首次发表大豆叶绿体reference的，所以我跟作者用的序列理应一样。统计AT含量，就是数AT有多少个，理应不涉及算法差异
赞一下 回复此楼
3楼2015-03-11 12:49:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

starseacow

专家顾问 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1 就算是64.6，是否仍高于其他植物，如是，最重要结论没问题就不是太有所谓了。
2 作者统计的序列有没有明确说明，是否是你现在计算的这个，有时候别人用了不同的大豆，有这种差异不奇怪。
3 你要觉得确实作者算错了，发封邮件给通讯作者问问看

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
5楼2015-03-11 14:57:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856，材料与化工321分求调剂 +12 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-03-28 10:56 by self2008
[考研] 283求调剂 +5 A child 2026-03-28 5/250 2026-03-28 10:13 by JourneyLucky
[考研] 材料求调剂一志愿哈工大324 +7 闫旭东 2026-03-28 9/450 2026-03-28 08:51 by Xu de nuo
[考研] 291求调剂 +6 HanBeiNingZC 2026-03-24 6/300 2026-03-28 07:55 by baoball
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-27 7/350 2026-03-28 07:43 by 热情沙漠
[考研] 275求调剂 +10 Micky11223 2026-03-25 13/650 2026-03-27 22:42 by Micky11223
[考研] 食品工程专硕一志愿中海洋309求调剂 +3 小张zxy张 2026-03-26 5/250 2026-03-27 18:42 by 小张zxy张
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +4 Ripcord上岸 2026-03-27 4/200 2026-03-27 17:00 by zhyzzh
[考研] 307求调剂 +8 超级伊昂大王 2026-03-24 9/450 2026-03-27 15:34 by 超级伊昂大王
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[硕博家园] 招收生物学/细胞生物学调剂 +3 IceGuo 2026-03-26 4/200 2026-03-27 05:35 by user003
[考研] 342求调剂 +3 加油a李zs 2026-03-26 3/150 2026-03-27 00:29 by wxiongid
[考研] 321求调剂 +5 材料cailiao 2026-03-21 5/250 2026-03-26 20:41 by fmesaito
[考研] 329求调剂 +5 1() 2026-03-22 5/250 2026-03-26 20:40 by fmesaito
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:26 by 星空星月
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭