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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 如何更改gromacs源代码
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迷失的自我

金虫 (初入文坛)

[求助] 如何更改gromacs源代码 已有1人参与

本人做硫系玻璃的模拟，而gromacs并不支持很多的硫系元素，我想请问如何添加这样的元素如Ge元素，求大神帮忙！！！！！
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1楼 2015-03-03 11:00:55
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
迷失的自我: 金币+50, ★★★很有帮助, 希望能够得到进一步帮助 2015-03-03 15:55:05
md新手？
软件是通用的，是否适合元素，要看有没有合适的势函数。并不需要修改程序源代码，修改输入的运行代码就可以了
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2楼2015-03-03 11:14:22
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迷失的自我

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-03-03 11:14:22
md新手？
软件是通用的，是否适合元素，要看有没有合适的势函数。并不需要修改程序源代码，修改输入的运行代码就可以了

不好意思，我确实是个新手，希望能够详细讲解一下这个合适的势函数，和修改运行代码
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3楼2015-03-03 15:54:08
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wbn

银虫 (小有名气)
★ ★
abinitio: 金币+2, 鼓励交流. 正解 2015-03-05 08:13:02
引用回帖:
3楼: Originally posted by 迷失的自我 at 2015-03-03 15:54:08
不好意思，我确实是个新手，希望能够详细讲解一下这个合适的势函数，和修改运行代码...

哪些元素支持哪些不支持跟【力场】有关，和软件无关。即使力场里没有你需要的，你也可以自己用量化软件计算或者从别的力场借用。这一切都可以写在【输入文件】里，不用改程序。请先读一下manual 第一，第四，第五章。
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4楼2015-03-05 01:14:54
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