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shengchen

铜虫 (初入文坛)

[求助] pfu酶使用 已有4人参与

请教各位一个问题,本人用一对引物从基因组上扩增片断,同等条件下用taq能扩出,pfu怎么也扩不出;当我用另一对引物从质粒上扩增时,同样的情况也出现了。。。并且经过测序,发现用taq扩出的目的片段都是对的,为什么pfu酶怎么也扩不出来,求教各位高手,谢谢!
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凡人皆有一死,凡人必须侍奉
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天地一微尘

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
shengchen(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-13 20:56:01
这是经常的事,同样的引物用不同的酶来扩增,有的可以扩出来,有的扩不出来。在用酶试的时候最好按照说明书上的比例来试。我经常遇到这种问题用一种酶怎么也扩不出来,换一种酶就OK了。试着换一下退火温度,变性时间等。
4楼2015-02-13 12:32:06
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still2008

至尊木虫 (著名写手)

破碎世界的守护者

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
shengchen: 金币+1 2015-02-13 21:44:09
体系不对,buffer不对?酶失活?排除过了吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
有时一本正经,有时胡言乱语。
2楼2015-02-12 23:47:55
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
shengchen: 金币+1 2015-02-13 21:44:20
pfu活性不如taq,试下提高模板浓度
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
3楼2015-02-13 02:25:13
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shengchen(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-02-13 20:56:12
呵呵,pfu的概念是高保真酶,那它为什么会有保真性呢,因为它能将错配的碱基切除,从而保真扩增中片段的正确性,所以它能切掉错误的碱基,所以它也可能将模板降解,导致扩增失败。所以,如果你的实验下游不需要进行精密实验的话,不建议使用保真酶。如果你担心普通的Taq酶扩增特异性差杂带较多的话,热启动Taq酶不是很好的选择吗,不会降解模板同时又能绝对的避免非特异性产物生成。
http://www.detaibio.com/relia-hotstart-polymerase.html
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
5楼2015-02-13 17:06:32
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