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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 预测的基因家族成员序列中间有终止密码子，是假基因吗？应该直接去除这条序列吗？
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catherineguo

铁虫 (初入文坛)

[求助] 预测的基因家族成员序列中间有终止密码子，是假基因吗？应该直接去除这条序列吗？已有2人参与

如题，预测基因家族成员时，发现序列中间有终止密码子，说明这是个假基因吗，要直接去掉这条序列，还是需要进一步分析？用SMART预测domain的时候，倒是终止密码子前后两段序列都有目标domain。

请高手多多赐教！非常感谢！
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1楼2015-02-11 15:05:35
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catherineguo

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ptttmt at 2015-02-11 15:47:14
怎么测序的？转录组？T载？PCR？？
经过拼接吗？ 仔细检查测序峰图，确认是不是误读？

谢谢！是从已发表的基因组序列中预测出来的，没有经过实验测序等
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3楼2015-02-11 16:38:29
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
catherineguo(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-12 21:17:07
怎么测序的？转录组？T载？PCR？？
经过拼接吗？ 仔细检查测序峰图，确认是不是误读？

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2015-02-11 15:47:14
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
catherineguo(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-12 21:17:43
还有可能是突变。最好多测一次，并且再测其他变种
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4楼2015-02-12 11:57:35
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by catherineguo at 2015-02-11 16:38:29
谢谢！是从已发表的基因组序列中预测出来的，没有经过实验测序等...

那最好扩出来测序看看
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5楼2015-02-12 11:58:36
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