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catherineguo

铁虫 (初入文坛)

[求助] 预测的基因家族成员序列中间有终止密码子,是假基因吗?应该直接去除这条序列吗? 已有2人参与

如题,预测基因家族成员时,发现序列中间有终止密码子,说明这是个假基因吗,要直接去掉这条序列,还是需要进一步分析?用SMART预测domain的时候,倒是终止密码子前后两段序列都有目标domain。

请高手多多赐教!非常感谢!
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
catherineguo(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-12 21:17:07
怎么测序的?转录组?T载?PCR??
经过拼接吗? 仔细检查测序峰图,确认是不是误读?

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-02-11 15:47:14
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catherineguo

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ptttmt at 2015-02-11 15:47:14
怎么测序的?转录组?T载?PCR??
经过拼接吗? 仔细检查测序峰图,确认是不是误读?

谢谢!是从已发表的基因组序列中预测出来的,没有经过实验测序等
3楼2015-02-11 16:38:29
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
catherineguo(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-12 21:17:43
还有可能是突变。最好多测一次,并且再测其他变种
4楼2015-02-12 11:57:35
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by catherineguo at 2015-02-11 16:38:29
谢谢!是从已发表的基因组序列中预测出来的,没有经过实验测序等...

那最好扩出来测序看看
5楼2015-02-12 11:58:36
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catherineguo

铁虫 (初入文坛)

谢谢各位!我也觉得是先保留,等测序验证后再确定。
6楼2015-03-03 17:15:40
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Takuya

新虫 (初入文坛)

你得先扩增基因并测序才能加以肯定,有时候公布的测序结果可能有误
7楼2015-03-25 15:59:56
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