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| 在用amber教程中（A15），有一个Packmol版块的使用，自己不了解怎么安装，初学者还望多多指教！教程上面只提供了一个网站：http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/ |
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2楼2015-01-30 20:37:58
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3楼2015-01-31 12:45:49
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4楼2015-01-31 13:19:06
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请问这样算安装成功了吗？ ------------------------------------------------------ Compiling packmol with /usr/bin/gfortran Flags: -O3 -ffast-math ------------------------------------------------------ Packmol succesfully built. ------------------------------------------------------ 为什么输入命令 packmol < input.inp后还会出现： If 'packmol' is not a typo you can run the following command to lookup the package that contains the binary: command-not-found packmol -bash: packmol: command not found 谢谢解答~ |
5楼2015-01-31 15:14:40
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7楼2015-01-31 16:26:27
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8楼2015-01-31 16:34:52
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提示信息如下： ############################################################## PACKMOL - Packing optimization for the automated generation of starting configurations for molecular dynamics. Version 14.225 ############################################################## Packmol must be run with: packmol < inputfile.inp Userguide at: www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol Reading input file... (Control-C aborts) Seed for random number generator: 19128787 Output file: ionic2.pdb Reading coordinate file: BF4.gjf.g03.log At line 258 of file io.f (unit = 10, file = 'BF4.gjf.g03.log') Fortran runtime error: End of file 请问这是哪里出错了，谢谢您了~ |
9楼2015-01-31 17:12:17
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