24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
查看: 2561  |  回复: 18

chuchu6816

金虫 (正式写手)

[求助] 求MS TraPPE Force Field已有1人参与

求TraPPE Force Field立场,做MOF材料的帮下忙。多谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

992648352

银虫 (小有名气)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2015-01-29 17:11:05
trappe的力场很好搞到,但是你标题写着MS,是不是想把trappe力场弄进MS?能行吗?
2楼2015-01-29 10:55:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuchu6816

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 992648352 at 2015-01-29 10:55:16
trappe的力场很好搞到,但是你标题写着MS,是不是想把trappe力场弄进MS?能行吗?

可以导入编译的力场。想做个CO2吸附的模拟,文献上都用的是trappe力场。大侠有的话,给我发发吧。多谢了啊。
3楼2015-01-29 14:28:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chuchu6816(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流 2015-01-29 17:11:11
chuchu6816: 金币+3, ★★★★★最佳答案, 请问 立场文件中 不如C的有 C_1 C_2 C_3,后面数值一样 他们有区别吗? 2015-01-29 18:51:49
http://www.chem.umn.edu/groups/siepmann/trappe/
这个是力场的网站,可以找到各种小分子的参数

以二氧化碳为例,势函数近似L-J形式,可以用L-J拟合出所需的参数,forcefield manager里将二氧化碳的L-J参数填进去
求MS TraPPE Force Field
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2015-01-29 14:54:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

力场文件里,C后面不跟数字标号,那么结构文件里的所有C都适用该参数
若需要区分结构里不同C使用不同的参数,比如羰基C和二氧化碳的C,那么力场文件里需要分开标注,C_1,C_2等等,并且在分配力场的时候可能需要手动分配指定

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2015-01-30 08:40:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuchu6816

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-30 08:40:54
力场文件里,C后面不跟数字标号,那么结构文件里的所有C都适用该参数
若需要区分结构里不同C使用不同的参数,比如羰基C和二氧化碳的C,那么力场文件里需要分开标注,C_1,C_2等等,并且在分配力场的时候可能需要手 ...

谢谢,终于明白了。
6楼2015-01-30 10:30:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuchu6816

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-30 08:40:54
力场文件里,C后面不跟数字标号,那么结构文件里的所有C都适用该参数
若需要区分结构里不同C使用不同的参数,比如羰基C和二氧化碳的C,那么力场文件里需要分开标注,C_1,C_2等等,并且在分配力场的时候可能需要手 ...

你用过sorption吗?其中method 中 Metropolis 与Configurational bias 有什么区别呢?
7楼2015-01-30 10:44:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
7楼: Originally posted by chuchu6816 at 2015-01-30 10:44:46
你用过sorption吗?其中method 中 Metropolis 与Configurational bias 有什么区别呢?...

sorption 我没怎么用过 你可以先在help查查这两个词的解释
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
8楼2015-01-30 10:47:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

明-明-

金虫 (小有名气)

楼主,你好!我最近也要在MS里面用到TraPPE,请问你最后将其用到程序计算中了吗?能否交流一下细节,还望不吝赐教,谢谢!
互相交流,互相学习
9楼2015-11-27 10:29:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

明-明-

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-29 14:54:16
http://www.chem.umn.edu/groups/siepmann/trappe/
这个是力场的网站,可以找到各种小分子的参数

以二氧化碳为例,势函数近似L-J形式,可以用L-J拟合出所需的参数,forcefield manager里将二氧化碳的L-J参数填进 ...

请问你的意思是不是说不用去下载TraPPE力场文件,而是找到计算所要用到的各种参数后,在MS中现存的三种力场之一中选择一个,譬如UFF进行修改(forcefield manager),然后应用修改后的力场文件进行优化等模拟操作?
互相交流,互相学习
10楼2015-11-27 20:48:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chuchu6816 的主题更新
信息提示
请填处理意见