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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求MS TraPPE Force Field
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chuchu6816

金虫 (正式写手)

[求助] 求MS TraPPE Force Field 已有1人参与

求TraPPE Force Field立场，做MOF材料的帮下忙。多谢！
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1楼 2015-01-29 09:27:21
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992648352

银虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2015-01-29 17:11:05
trappe的力场很好搞到，但是你标题写着MS，是不是想把trappe力场弄进MS？能行吗？
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2楼2015-01-29 10:55:16
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chuchu6816

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 992648352 at 2015-01-29 10:55:16
trappe的力场很好搞到，但是你标题写着MS，是不是想把trappe力场弄进MS？能行吗？

可以导入编译的力场。想做个CO2吸附的模拟，文献上都用的是trappe力场。大侠有的话，给我发发吧。多谢了啊。
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3楼2015-01-29 14:28:14
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chuchu6816(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流 2015-01-29 17:11:11
chuchu6816: 金币+3, ★★★★★最佳答案, 请问 立场文件中 不如C的有 C_1 C_2 C_3，后面数值一样 他们有区别吗？ 2015-01-29 18:51:49
http://www.chem.umn.edu/groups/siepmann/trappe/
这个是力场的网站，可以找到各种小分子的参数

以二氧化碳为例，势函数近似L-J形式，可以用L-J拟合出所需的参数，forcefield manager里将二氧化碳的L-J参数填进去
求MS TraPPE Force Field
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2015-01-29 14:54:16
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
力场文件里，C后面不跟数字标号，那么结构文件里的所有C都适用该参数
若需要区分结构里不同C使用不同的参数，比如羰基C和二氧化碳的C，那么力场文件里需要分开标注，C_1，C_2等等，并且在分配力场的时候可能需要手动分配指定
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chuchu6816
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2015-01-30 08:40:54
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chuchu6816

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-30 08:40:54
力场文件里，C后面不跟数字标号，那么结构文件里的所有C都适用该参数
若需要区分结构里不同C使用不同的参数，比如羰基C和二氧化碳的C，那么力场文件里需要分开标注，C_1，C_2等等，并且在分配力场的时候可能需要手 ...

谢谢，终于明白了。
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6楼2015-01-30 10:30:00
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chuchu6816

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-30 08:40:54
力场文件里，C后面不跟数字标号，那么结构文件里的所有C都适用该参数
若需要区分结构里不同C使用不同的参数，比如羰基C和二氧化碳的C，那么力场文件里需要分开标注，C_1，C_2等等，并且在分配力场的时候可能需要手 ...

你用过sorption吗？其中method 中 Metropolis 与Configurational bias 有什么区别呢？
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7楼2015-01-30 10:44:46
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
7楼: Originally posted by chuchu6816 at 2015-01-30 10:44:46
你用过sorption吗？其中method 中 Metropolis 与Configurational bias 有什么区别呢？...

sorption 我没怎么用过 你可以先在help查查这两个词的解释
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
8楼2015-01-30 10:47:54
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明-明-

金虫 (小有名气)
楼主，你好！我最近也要在MS里面用到TraPPE，请问你最后将其用到程序计算中了吗？能否交流一下细节，还望不吝赐教，谢谢！
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互相交流，互相学习
9楼2015-11-27 10:29:03
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明-明-

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-29 14:54:16
http://www.chem.umn.edu/groups/siepmann/trappe/
这个是力场的网站，可以找到各种小分子的参数

以二氧化碳为例，势函数近似L-J形式，可以用L-J拟合出所需的参数，forcefield manager里将二氧化碳的L-J参数填进 ...

请问你的意思是不是说不用去下载TraPPE力场文件，而是找到计算所要用到的各种参数后，在MS中现存的三种力场之一中选择一个，譬如UFF进行修改（forcefield manager），然后应用修改后的力场文件进行优化等模拟操作？
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互相交流，互相学习
10楼2015-11-27 20:48:30
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