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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » cDNA-AFLP的数据处理
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2009355147

金虫 (小有名气)

[求助] cDNA-AFLP的数据处理 已有1人参与

求助，好不容易把cDNA-AFLP的凝胶跑完，读完1  0的原始矩阵，然后……怎么处理，实验室没人做呀，没人指导，老板也不管，求助，跪求~跪求在线求助呀！
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1楼 2015-01-28 19:23:49
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
2009355147(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:07:30
用spss分析你读出条带的0和1即可。具体不会再问。
应用 UPGMA、SPSS等聚类分析软件进行分析。
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
2楼2015-01-28 21:57:08
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2009355147

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2015-01-28 21:57:08
用spss分析你读出条带的0和1即可。具体不会再问。
应用 UPGMA、SPSS等聚类分析软件进行分析。

先谢谢你了，我已经完成读带工作，准备用GenAlex 6.3中的Binary功能处理数据，用Binary建立的初始表格，我就是不知道怎么把我读的带的数据怎么带入到这个Binary表格里，真的谢谢你了
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3楼2015-01-29 16:13:38
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人
引用回帖:
3楼: Originally posted by 2009355147 at 2015-01-29 16:13:38
先谢谢你了，我已经完成读带工作，准备用GenAlex 6.3中的Binary功能处理数据，用Binary建立的初始表格，我就是不知道怎么把我读的带的数据怎么带入到这个Binary表格里，真的谢谢你了...

我使用excel建立的初始表格,然后复制粘贴到Binary表格里的
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
4楼2015-01-29 17:42:13
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2009355147

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2015-01-29 17:42:13
我使用excel建立的初始表格,然后复制粘贴到Binary表格里的...

我的读带结果每个物种下面都有好多0 1 可是我建立的Binary的表格里 每个引物的每个表格里只有一个数字，我怎么能把一串数字输入到一个表格里？还是我读带读错了，是要读这个物种在这个引物下一共有多少条带？
cDNA-AFLP的数据处理
捕获1.PNG


cDNA-AFLP的数据处理-1
捕获.PNG
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5楼2015-01-29 20:05:04
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2009355147

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2015-01-29 17:42:13
我使用excel建立的初始表格,然后复制粘贴到Binary表格里的...

或者你能不能给我截个屏，让我看一下你输入Binary的数据格式？这的谢啦，非常感谢你，在无助的时候有人回复
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6楼2015-01-29 20:07:25
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 2009355147 at 2015-01-29 20:07:25
或者你能不能给我截个屏，让我看一下你输入Binary的数据格式？这的谢啦，非常感谢你，在无助的时候有人回复...

跟你这差不多啊，你这怎么不行呢
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
7楼2015-01-29 20:43:35
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2009355147

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2015-01-29 20:43:35
跟你这差不多啊，你这怎么不行呢...

你是怎么读AFLP的带的？
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8楼2015-01-29 20:55:48
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2009355147

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2015-01-29 20:43:35
跟你这差不多啊，你这怎么不行呢...

我这一竖排的红色的都是一个物种在一个引物下的读带结果，下面的图里的一个红表格是处理软件里的一个物种在一个引物下对应的一个数据格，这怎么能粘贴呢？
cDNA-AFLP的数据处理-2
捕获 - 副本.PNG


cDNA-AFLP的数据处理-3
捕获1.PNG
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9楼2015-01-29 21:01:54
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wanglei8851

银虫 (小有名气)
请问楼主的目的是构建图谱还是品种鉴定呢还是？我用的是joinmap4.0主要是构图谱的，这个软件还能简单实用下。
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10楼2015-01-30 15:41:27
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