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MS里三斜晶系的坐标导入lammps里有变化
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我想把在MS里建的HCP结构导入lammps计算。如果建的是正交的HCP,那么导出后原子的坐标和在MS里的实际坐标(即不是分数的那个坐标)是一样的。可是当我建三斜的HCP结构时,导出的坐标与MS里的实际坐标完全不同。 在MS里,建的三斜晶体的坐标是 (括号里是对应的分数坐标) 1 1 0 0 0 (0 0 0) 2 1 0.771363 4.45060 5.61922 (1/6 5/6 1/2) 3 1 1.54273 2.26725 1.71039 (1/3 1/3 0) 4 1 2.31409 1.74238 4.76403 (1/2 1/6 1/2) 5 1 3.08545 4.53449 3.42077 (2/3 2/3 0) 6 1 3.85681 4.00962 6.47441 (5/6 1/2 1/2) 导出来之后就变成了 1 1 0 0 0 2 1 4.66499 4.848 2.591 3 1 2.79899 1.616 0 4 1 4.66499 1.616 2.591 5 1 5.59799 3.232 0 6 1 7.46398 3.232 2.591 感觉是跟着分数坐标在走。 这是什么原因,有什么解决办法吗? |
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