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zhangtao110

银虫 (小有名气)

[求助] 双酶切问题 已有3人参与

这个质粒是商品化的质粒,不过被改造了,如图,多克隆位点用第一个(EcoR1)和最后一个(Hind 3)酶切开后除去了该多克隆位点,即用笔划去的部分,替换了上面的多克隆位点,上面这段多克隆位点的详细信息在下图中,
这个重组质粒目的是为了加上FLAG标签,用于后期目的蛋白的筛选,现在我提出了质粒,由于原质粒8958kb,切除多克隆位点又加上一段序列后大概10000kb左右,现在做双酶切,选了3×FLAG标签之前的唯一一个酶,即Spe1,XB3是原来他们实验室构建载体时加入的他们的目的基因,不用管,另一个酶选了Sma1,但由于双酶切切不开又换了一个酶,Sac1,意思就是Spe1与Sma1和Sac1搭配着双酶切,但是每次切过之后都发现只有一条带,原本要是双酶切都切开的话应该会有条800左右的条带,但是一直看不到,双酶切之后的电泳图片与对比的质粒电泳图片不同,于是我怀疑只有一个酶发挥了作用,于是想看看到底是哪个酶有问题,所以做了三种酶的单酶切,所有的电泳结果在下面,我会一一叙述每个条带
从左到右依次是超螺旋MARK,Spe1和Sma1双酶切,Spe1和Sac1双酶切,质粒(浓度和其它都一样,用来对比的),Spe1单酶切,Sac1单酶切,Sma1单酶切,15000kbMark.现在看来就是Spe1切得有问题,我用的体系是20ul,质粒10ul,10×M 2ul,1ul酶,加水补到20ul,大家给我分析Spe1单酶切怎么回事,为什么会出现三条带,是不是酶量不够,部分酶切了?还是有星活性和甲基化影响?下一步我该怎么做呢?谢谢

双酶切问题
捕获.PNG


双酶切问题-1
1.PNG


双酶切问题-2
2015.01.21 meiqie flag.jpg
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feimengzc

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zhangtao110(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-23 21:49:53
应该是Spe1失活了,没起作用,那样质粒就没切开,跑出的是三条带,双螺旋,开环,线性
淡然于心,从容于表,放开执念,随缘是最好的生活。
2楼2015-01-23 17:01:23
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zshw_001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zhangtao110(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-23 21:50:05
一般是没切开,多切一会或者酶切过夜,双酶切还要注意buffer合适不。
永远相信未知的总是美好的!
3楼2015-01-23 17:53:08
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zhangtao110

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by feimengzc at 2015-01-23 17:01:23
应该是Spe1失活了,没起作用,那样质粒就没切开,跑出的是三条带,双螺旋,开环,线性

酶是新买的,可不可能是位点甲基化了呢

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-01-23 18:19:01
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zhangtao110

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zshw_001 at 2015-01-23 17:53:08
一般是没切开,多切一会或者酶切过夜,双酶切还要注意buffer合适不。

是不是切开了部分,毕竟与未酶切的质粒电泳图不同了

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-01-23 18:20:47
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我觉得你可以在选择一下别的合适的酶切位点,有时候确实双酶切不好切
6楼2015-01-23 21:32:45
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zhangtao110

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2015-01-23 21:32:45
我觉得你可以在选择一下别的合适的酶切位点,有时候确实双酶切不好切

可是我右边的酶切位点只有spe1一个呀!

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-01-23 21:59:57
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2298827423

银虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1 2016-08-15 07:54:51
引用回帖:
7楼: Originally posted by zhangtao110 at 2015-01-23 21:59:57
可是我右边的酶切位点只有spe1一个呀!
...

我也遇到了同样的问题,请问您是怎么解决的,求回复,谢谢
8楼2016-08-14 17:22:52
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