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glenn_007

木虫 (小有名气)

[交流] 紧急求助:克隆蓝白斑实验出现假阳性!!!

各位大侠,请帮帮忙,我先遇到一些奇怪的现象,不知如何改进:

    我的目标片段是600—700bp,T载体链接后,转化克隆,然后蓝白斑实验筛选。挑出白色colony,摇菌,最后制备质粒。
    但是送去测序的样片却显示全部是载体序列。重复了很多次,也都是这样的结果,我现在制备质粒之前,直接做PCR,结果显示也没有目标片段的扩增。这与测序的结果一致,证明里面并没有插入片段。但是蓝白斑实验明明是有白色的colony啊,虽然少了一点,但是与蓝斑对比,确实是白色的很明显。
   
    我不知道是哪里出了问题。请大家帮帮我?
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humants

金虫 (正式写手)

有可能使载体自连太严重了,
你的T载体是不是很长时间了?你做一个T载体自连实验,看一下,是不是自连率很高!如果是建议换一批T载体,
如果是新载体,自连很厉害,你可以找试剂公司让他给你换一批!

祝你好运1
2楼2008-06-05 11:12:33
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glenn_007

木虫 (小有名气)

我现在也怀疑是载体的原因,我用的载体是实验室自己配置的。刚用别人试剂盒的载体拿来试验一下。

但我还是很奇怪如果是载体自连的话,也应该是蓝斑,不应该是白斑吧。
3楼2008-06-05 11:40:13
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轻5飞扬

金虫 (正式写手)

晕,提了质粒不做酶切和PCR鉴定就直接测么,太浪费了吧,呵
4楼2008-06-05 11:41:05
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glenn_007

木虫 (小有名气)

呵呵,我目前待的这个实验室的传统说是不用做,因为成功率高。
不过现在做了,呵呵~
5楼2008-06-05 11:45:57
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wwfifa

铜虫 (小有名气)

也有可能是假阳性吧,你测序之前先提质粒,pcr验证看看有没有所需条带。然后再测序
6楼2008-06-05 16:06:49
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hulqi

金虫 (正式写手)

1)有可能是载体自连的假阳性;
2)作时AMP、IPTG和X-Gal其中一种或几种没涂均匀。
3)有时即使插入片段也会出现篮斑。只要编码框没被破坏。
如果实验室别人用这个载体没问题,那么可能就是2、3原因。重做一遍,如果还是那样,很可能是你的插入序列并没有破坏其编码框,换个载体试试吧。
7楼2008-06-05 17:06:24
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xclj369ouc

金虫 (小有名气)

我最近也在做蓝白筛选,假阳性的比例挺大的。假阳性的可能有很多种,主要和菌的生长有很大关系,并不一定是白色就有插入片段的。相反,有些显蓝色的,却可能有插入片段,因为插入片段较短(<500bp),并且没有影响LacZ基因的读框,因此菌落就可能现蓝色或浅蓝。
8楼2008-06-08 14:44:34
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glenn_007

木虫 (小有名气)

谢谢大家的支持。
现在我已经找到原因了,是载体的问题,由于我之前用的载体是Lab内自己配置的,所以不是太好,白斑非常少不说,而且大部分都是假的,借了另一个实验室的从试剂公司买来的载体以后,效果非常好~现在我的实验已经可以进行下去了。
再次感谢大家的回帖!

请版主帮忙扣除我的金币,奖励给2楼humants,7楼的hulqi,8楼的xclj369ouc各一个。
谢谢大家!
9楼2008-06-23 11:53:04
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