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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 二氧化硅晶体cleave plane问题
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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 二氧化硅晶体cleave plane问题 已有1人参与

我用SiO2的晶胞，a=b=4.913437，c=5.405118。α=β=90°，γ=120°。在三维做了个8*8*8的超级晶胞然后用011面去截，请问图中的mesh lengthes是怎么确定的？修改不了，这个对于所截的面会有什么影响吗？

二氧化硅晶体cleave plane问题
11.jpg


二氧化硅晶体cleave plane问题-1
22.jpg
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1楼 2015-01-20 23:04:20
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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-01-21 14:08:40
mesh length的计算应该根据U V有一套计算公式，具体公式我不知道。
不过我觉得不必纠结于这个问题，U V按系统默认数据即可。
至于你说调节切出来的晶面的尺寸问题，通常的做法是，从一个晶胞开始，调节到自 ...

多谢哈。一般调整成U和V垂直，这样以后Supercell的时候表面也会是矩形。但这样的话截的时候V所在的截边会很长... 而且即使是用原胞去做一个截面，但是UV所在边长也是固定的，这样我的模拟系统里怎样取任意表面积的二氧化硅层呢？Supercell的时候只能填整数~
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10楼2015-01-21 15:53:05
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王小福吼吼

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
吉米爱多: 金币+10 2015-01-21 10:19:06
abinitio: 金币+1, 感谢精彩应助！ 2015-01-21 15:31:31
截取晶面，在surface box中，设置（011）。至于surface mesh中的U,V我也不太懂。
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2楼2015-01-21 09:49:36
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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 王小福吼吼 at 2015-01-21 09:49:36
截取晶面，在surface box中，设置（011）。至于surface mesh中的U,V我也不太懂。

谢谢呵呵。U,V应该是指在cleave plane位置确定后，确定截面的形状吧。改变U,V向量mesh length也会变不知道是怎么变的
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3楼2015-01-21 10:19:08
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
★
吉米爱多(abinitio代发): 金币+1, 感谢精彩应助！ 2015-01-21 15:31:44
引用回帖:
3楼: Originally posted by 吉米爱多 at 2015-01-21 10:19:08
谢谢呵呵。U,V应该是指在cleave plane位置确定后，确定截面的形状吧。改变U,V向量mesh length也会变不知道是怎么变的...

表示赞同，U V决定切出来的截面的形状和尺寸，不过只要cleave plane和position中的top确定之后，该截面暴露的原子群是完全一致的。此外，cleave plane确定之后，U V的数值能调节的范围需限定在指定的cleave plane确定的平面之内，即U V可调节的范围是有限的。
由于在暴露的原子组决定了表面性质，所以尽管截面形状尺寸可能不同，考虑到周期性，表面性质是一样的。
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吉米爱多
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2015-01-21 10:37:09
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