应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 甲烷水合物建模
51/1返回列表
查看: 3924  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

georgexuz

新虫 (初入文坛)

[求助] 甲烷水合物建模 已有1人参与

利用MS软件建甲烷和水合物晶胞，build选crystals建晶体，添加原子，结果氢原子多了好多，大神来解释

甲烷水合物建模
~0W~6J@98E5R@N35]ZR]U5R.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MS学习

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-01-12 15:26:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

georgexuz

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-13 08:58:50
建模的时候只要把C和O画出来
然后make P1
自动补足C和O上的H原子，就是水合物结构了

你多出来的H是因为对称性生成的

多谢回答，如果氢原子的位置自动生成，文献中已经给了氢原子位置，生成的结构虽然氢原子数目对了，但也不太一样啊？
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-13 10:48:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
georgexuz(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-01-13 10:05:03
georgexuz: 金币+10, ★有帮助 2015-01-14 21:38:59
建模的时候只要把C和O画出来
然后make P1
自动补足C和O上的H原子，就是水合物结构了

你多出来的H是因为对称性生成的
赞一下(2人) 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2015-01-13 08:58:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

georgexuz

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wgz_tju at 2015-01-12 20:02:19
直接下载一个单体结构就好了

这就是在网上下载，导入MS后就这样，自己一步步建也是这样
赞一下 回复此楼
5楼2015-01-13 10:50:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
4楼: Originally posted by georgexuz at 2015-01-13 10:48:37
多谢回答，如果氢原子的位置自动生成，文献中已经给了氢原子位置，生成的结构虽然氢原子数目对了，但也不太一样啊？...

如果不改空间群肯定会H原子多的

或者你把这个结构make P1 手动一个个删掉多余的H原子
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2015-01-13 10:58:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 5/250 2026-08-26 07:17 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +22 木水思豆 2026-08-25 25/1250 2026-08-26 07:16 by jklily
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 PbwVEMK5haaE 2026-08-25 6/300 2026-08-26 06:57 by cNXvBfCpiZOM
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Qj98d49dHFb9 2026-08-25 5/250 2026-08-26 04:57 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +18 angus9576 2026-08-25 22/1100 2026-08-26 00:41 by merchancy
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 科研孤儿太难了 +18 我4大白菜 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by 凯恩广盛催化分�
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭