应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 甲烷水合物建模
111/2返回列表12下一页
查看: 3927  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

georgexuz

新虫 (初入文坛)

[求助] 甲烷水合物建模 已有1人参与

利用MS软件建甲烷和水合物晶胞，build选crystals建晶体，添加原子，结果氢原子多了好多，大神来解释

甲烷水合物建模
~0W~6J@98E5R@N35]ZR]U5R.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MS学习

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-01-12 15:26:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
georgexuz(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-01-13 10:05:03
georgexuz: 金币+10, ★有帮助 2015-01-14 21:38:59
建模的时候只要把C和O画出来
然后make P1
自动补足C和O上的H原子，就是水合物结构了

你多出来的H是因为对称性生成的
赞一下(2人) 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2015-01-13 08:58:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

wgz_tju

金虫 (小有名气)
★ ★
georgexuz(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-01-13 07:52:05
内容已删除
回复此楼
2楼2015-01-12 20:02:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

georgexuz

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-13 08:58:50
建模的时候只要把C和O画出来
然后make P1
自动补足C和O上的H原子，就是水合物结构了

你多出来的H是因为对称性生成的

多谢回答，如果氢原子的位置自动生成，文献中已经给了氢原子位置，生成的结构虽然氢原子数目对了，但也不太一样啊？
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-13 10:48:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

georgexuz

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wgz_tju at 2015-01-12 20:02:19
直接下载一个单体结构就好了

这就是在网上下载，导入MS后就这样，自己一步步建也是这样
赞一下 回复此楼
5楼2015-01-13 10:50:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
4楼: Originally posted by georgexuz at 2015-01-13 10:48:37
多谢回答，如果氢原子的位置自动生成，文献中已经给了氢原子位置，生成的结构虽然氢原子数目对了，但也不太一样啊？...

如果不改空间群肯定会H原子多的

或者你把这个结构make P1 手动一个个删掉多余的H原子
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2015-01-13 10:58:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

23秒，32年

新虫 (初入文坛)
请问楼主后来是怎么解决的，卡在这里好久了，如果去掉对称性再自动加氢，好像生成的不是笼形结构
赞一下 回复此楼
7楼2016-10-26 15:10:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

23秒，32年

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by georgexuz at 2015-01-13 10:48:37
多谢回答，如果氢原子的位置自动生成，文献中已经给了氢原子位置，生成的结构虽然氢原子数目对了，但也不太一样啊？...

请问楼主后来是怎么解决的，卡在这里好久了，如果去掉对称性再自动加氢，好像生成的不是笼形结构
赞一下 回复此楼
8楼2016-10-26 15:11:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hejupeng

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 23秒，32年 at 2016-10-26 15:11:35
请问楼主后来是怎么解决的，卡在这里好久了，如果去掉对称性再自动加氢，好像生成的不是笼形结构...

我也想问一下，我的从晶体库导入到MS中，氢原子没有，想问一下

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
9楼2016-10-27 10:36:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱在离别时hy

新虫 (初入文坛)
请问下您是么建边界框子？

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
10楼2017-02-28 14:13:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 georgexuz 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-26 21:15 by xxniao123
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 基金不中，共勉 +3 eulota 2026-08-26 3/150 2026-08-26 16:17 by 路yyyy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭