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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 正在扩增李斯特菌的hly基因,但是换了三对引物都扩不出来~ 已有2人参与

买了单核细胞增生李斯特菌19115的菌株,干粉溶解后培养提取DNA,浓度20ng/ul或50ng/ul,针对该菌保守基因hly设计引物,产物大小1600、2000、600bp,但是怎么跑都无带产生,引物可以看到二聚体。。是菌的问题,提取的问题,还是PCR问题,或者引物问题?
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
因素太多了,一一排除吧
2楼2015-01-11 21:43:01
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可能的原因有
① 模板提取时候出现问题,PCR扩增的时候模板已经降解,无模板进行扩增,所以跑不出条带
② 引物设计不合理,无法与模板结合进行延伸(但是这种可能性较小)
③ 反应体系的问题,就是酶的问题,不知道你用的是什么酶,酶的特异性太差,没有指导正确模板的扩增,反而产生了引物二聚体,如果是这样,换酶就行了
总的来说,着重考虑两方面原因:酶和模板,希望对你有所帮助
http://www.detaibio.com/relia-hotstart-polymerase.html
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
3楼2015-01-12 09:10:45
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