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xuxiaoxianer

银虫 (初入文坛)

[求助] 连接转化 已有4人参与

本人刚接触分子实验不久,还处于摸索阶段,反复实验遇到相同的问题,请路过的各位师兄师姐能不吝赐教,在下感激不尽。。。。
试验中 我提取材料的RNA反转录之后,PCR克隆出全长,如图00:MARKER条带七条,依次是100 250 500 750 1000 1500 2000  我的基因全长1300多bp,切胶回收后用PMD18-T进行连接,连接体系10ul  为(pcr回收产物4.5ul,PMD18-T 0.5ul,solutionI 5ul),16度连接4小时,因为曾经做过16度4小时并没有连接上,所以又做了一组16度连接了13个小时,继续涂板转化,均长出菌落,挑菌摇菌后10个小时,也变混浊,但是做菌液pcr检测的结果却是弥散,同时做的另一个基因却做的很好。图11是16度连接4个小时的菌液pcr,图22是连接13个小时的菌液pcr,请大家帮忙看看到底是我哪里出了问题?(抱拳)

连接转化
11.jpg


连接转化-1
22.jpg


连接转化-2
00.jpg
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cuihao102

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2015-01-11 15:32:18
建议你把质粒提出来跑电泳,再以质粒做模板扩增验证一下

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-01-11 10:46:00
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+2, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2015-01-11 15:32:27
建议重新扩增基因片段。回收之后再做检测,确定目的片段后,再做连接转化,稳妥些。从这个结果看,我不认为你扩增出来了可用以连接的目的片段。若目的基因没问题,那再看连接转化的细节把握。
3楼2015-01-11 13:29:29
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zhangbighui

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议换个T载体,什么年代了还用18-T,效率低时间长,可以考虑全氏金的blunt sample T载体,T-3载体。再者,可考虑提取质粒酶切鉴定,PCR鉴定假阳性太多。
成功,就是成为你想成为的人
4楼2015-01-11 19:47:26
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叶叶梦

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
目的基因没有连接上,本人觉得换种连接载体试试,或者你的菌落再提个质粒看看是不是已经有目的基因了,
5楼2015-01-13 22:04:42
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xuxiaoxianer

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cuihao102 at 2015-01-11 10:46:00
建议你把质粒提出来跑电泳,再以质粒做模板扩增验证一下

谢谢,挑选几个提质粒依旧没条带,换了另外一种载体,做了40个才得到一个有条带的,还是很谢谢你的回答~~
6楼2015-01-29 09:09:23
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xuxiaoxianer

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-01-11 13:29:29
建议重新扩增基因片段。回收之后再做检测,确定目的片段后,再做连接转化,稳妥些。从这个结果看,我不认为你扩增出来了可用以连接的目的片段。若目的基因没问题,那再看连接转化的细节把握。

应该是载体不合适,换了一种载体,艰难的得到了一个有条带的,谢谢你的回复~~
7楼2015-01-29 09:10:31
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xuxiaoxianer

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangbighui at 2015-01-11 19:47:26
建议换个T载体,什么年代了还用18-T,效率低时间长,可以考虑全氏金的blunt sample T载体,T-3载体。再者,可考虑提取质粒酶切鉴定,PCR鉴定假阳性太多。

谢谢,果然是载体的问题,换了一种载体,终于在40个样中有一个出现了条带~
8楼2015-01-29 09:11:25
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xuxiaoxianer

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 叶叶梦 at 2015-01-13 22:04:42
目的基因没有连接上,本人觉得换种连接载体试试,或者你的菌落再提个质粒看看是不是已经有目的基因了,

嗯嗯,确实是载体的问题,换了一种载体,现在菌液Pcr跑出有条带的了~谢谢
9楼2015-01-29 09:12:21
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