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shixha

银虫 (小有名气)

[交流] chgdiff.pl 处理电荷差分密度 已有1人参与

本来想用chgdiff.pl处理电荷差分密度, 但处理三个文件时有个小bug的, 浪费半天时间  OMG  写下来供借鉴
1. 因为原子信息保留了file1的信息, 应该倒过来,  file1-file2
2. printf  OUT输出前加个空格, 保持与VASP格式一致

修改:
81c81
<         $line1[$j] = $line1[$j]-$line2[$j];
---
>         $line1[$j] = $line2[$j]-$line1[$j];
83c83
<     printf OUT " %18.11E %18.11E %18.11E %18.11E %18.11E\n",$line1[1],$line1[2],$line1[3],$line1[4],$line1[5];  
---
>     printf OUT "%18.11E %18.11E %18.11E %18.11E %18.11E\n",$line1[1],$line1[2],$line1[3],$line1[4],$line1[5];

chgdiff.pl CHGCAR1 CHGCAR2
mv CHGCAR_diff  tmp
chgdiff.pl tmp CHGCAR3
得到差分密度:CHGCAR1-CHGCAR2-CHGCAR3
用网上找的fortran处理得到plane-averaged difference electronic density,  注意删除原子符号那行
齐活!
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朱全喜

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
非常感谢你的这篇帖子,希望以后还可以交流。
2楼2015-05-27 16:28:40
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