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chgdiff.pl 处理电荷差分密度 已有1人参与
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本来想用chgdiff.pl处理电荷差分密度, 但处理三个文件时有个小bug的, 浪费半天时间 OMG 写下来供借鉴 1. 因为原子信息保留了file1的信息, 应该倒过来, file1-file2 2. printf OUT输出前加个空格, 保持与VASP格式一致 修改: 81c81 < $line1[$j] = $line1[$j]-$line2[$j]; --- > $line1[$j] = $line2[$j]-$line1[$j]; 83c83 < printf OUT " %18.11E %18.11E %18.11E %18.11E %18.11E\n",$line1[1],$line1[2],$line1[3],$line1[4],$line1[5]; --- > printf OUT "%18.11E %18.11E %18.11E %18.11E %18.11E\n",$line1[1],$line1[2],$line1[3],$line1[4],$line1[5]; chgdiff.pl CHGCAR1 CHGCAR2 mv CHGCAR_diff tmp chgdiff.pl tmp CHGCAR3 得到差分密度:CHGCAR1-CHGCAR2-CHGCAR3 用网上找的fortran处理得到plane-averaged difference electronic density, 注意删除原子符号那行 齐活! |
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朱全喜
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