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【求助】新人发帖,说一说自己的郁闷----用autodock跑出了一个2G大的dlg结果。
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用计算机跑了3天,跑出来这么一个令我苦笑不得结果,感觉非常郁闷,我的配体是利迪链菌素,从chembank里下载的,格式为sdf,自己转委pdbqt,受体为hiv蛋白,哭啊,各位大侠帮帮俺啊。 求帮助如下: 1.各位大侠的sybyl是哪里来的啊,如果是破解的,能告诉我哪里下载的吗? 2.从pdb文件把不同的分子分离出来,大家都用什么软件啊,除了sybyl还有别的免费的吗? 2.summarize_rusults4.py命令如何用啊,虽然我用了help,也没看懂(大家可以尽情的鄙视我),-d 后面是跟dlg文件吗,每次运行都说 Traceback (most recent call last): File "./summarize_results4.py", line 306, in coords = d.ligMol.allAtoms.coords[:] AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' 求救求救。 [ Last edited by zzgyb on 2008-5-31 at 15:27 ] |
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