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【求助】新人发帖，说一说自己的郁闷----用autodock跑出了一个2G大的dlg结果。
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用计算机跑了3天，跑出来这么一个令我苦笑不得结果，感觉非常郁闷，我的配体是利迪链菌素，从chembank里下载的，格式为sdf，自己转委pdbqt，受体为hiv蛋白，哭啊，各位大侠帮帮俺啊。 求帮助如下： 1.各位大侠的sybyl是哪里来的啊，如果是破解的，能告诉我哪里下载的吗？ 2.从pdb文件把不同的分子分离出来，大家都用什么软件啊，除了sybyl还有别的免费的吗？ 2.summarize_rusults4.py命令如何用啊，虽然我用了help，也没看懂（大家可以尽情的鄙视我），-d 后面是跟dlg文件吗，每次运行都说 Traceback (most recent call last): File "./summarize_results4.py", line 306, in coords = d.ligMol.allAtoms.coords[:] AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' 求救求救。 [ Last edited by zzgyb on 2008-5-31 at 15:27 ] |
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