| 查看: 1160 | 回复: 2 | |||
[求助]
Gromacs 做教程1 水中溶菌酶时,npt压力不是1个大气压。 已有2人参与
|
| 先做了em,又做了nvt(平均温度是299k,与300k接近),在做到NPT的时候,用gmx_mpi energy -f npt.edr -o pressure.xvg 发现得到的平均压力不是设定的1个大气压,每次做的结果都不一样,有时是正的,有时是负的,不定。所有的输入文件和.mdp都是教程上的,没有做过改动,用的版本是5.0.2。希望做过的大侠们能指点一下小弟。http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... yme/01_pdb2gmx.html这是教程的链接。 |
» 猜你喜欢
存款400万可以在学校里躺平吗
已经有5人回复
拟解决的关键科学问题还要不要写
已经有5人回复
基金委咋了?2026年的指南还没有出来?
已经有9人回复
基金申报
已经有5人回复
国自然申请面上模板最新2026版出了吗?
已经有17人回复
纳米粒子粒径的测量
已经有8人回复
疑惑?
已经有5人回复
计算机、0854电子信息(085401-058412)调剂
已经有5人回复
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有5人回复
溴的反应液脱色
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?
已经有7人回复
zhangmao511
铁虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 33
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 29.7小时
- 虫号: 2553312
- 注册: 2013-07-19
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
2楼2015-01-20 08:54:51
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2015-01-20 15:11:53











回复此楼