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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 分子模拟中刚柔性和亲水性怎么表示 已有2人参与

如题,在聚合物链中,由于主链上是否还带其它基团(如甲基)对宏观性能影响很大,现在只能猜测是这两个因素,
一个是链的刚柔性不一样,另一个是链的亲水性不一样,想通过分子模拟来求证,可是要怎么表征呢?
请大侠指点,金币好说
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fanc232

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-12-26 09:39:13
非常感谢您的回复,很有启发,对于亲水性还有些许疑惑:
1. 聚合物在溶剂中做完能量最小化,难道不是所有的原子或基团都暴露在溶液中吗?
2. 基团的面积如何测呢?
再次感谢您...

您好,我是生物背景的,而且经验不多,很抱歉在解答您问题的时候没有跳出我自己的思维圈子。
1.我一直认为长链化合物放在溶剂里,跟溶剂亲和的部位倾向于暴露在外,跟溶剂排斥的部位倾向于互相聚合,被包裹在内。就跟蛋白质折叠似的。所以我不认为所有原子或基团都暴露在溶液中,除非聚合物的链很短。
2.关于基团的亲水面积和疏水面积,我只知道肯定有软件可以自动计算,比如schrodinger、SYBYL、Discovery Studio之类,这些是我自己常用的分子编辑软件。楼主可以翻翻自己常用的分子编辑软件的说明书,找找这个功能应该怎么用。
我很喜欢计算机辅助药物设计
9楼2014-12-26 10:46:23
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查看全部 16 个回答

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

补充一点,这个聚合物本身就具有一定的水溶性,我看论坛里都说用接触角仪测接触角,对于水溶性的聚合物也适用吗?
2楼2014-12-25 18:25:53
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ktwyw

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没看懂你具体的问题。高分子物理里表征链的静态柔顺性的参数是持久长度,水溶性你可以去查聚合物与水的Flory-huggins参数,这些物理量实验上都可以测,分子模拟里面原则上也可以算,这样算回答你的问题么?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好学习,天天向上。
3楼2014-12-25 18:46:12
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

打个比方,如下图,左边和右边聚合物的区别在于右边的主链上挂了一个甲基,那么我现在想比较两者的分子刚柔性和亲水性,请问如何通过分子模拟来表征呢?
分子模拟中刚柔性和亲水性怎么表示
1.png

4楼2014-12-25 19:00:17
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