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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 分子模拟中刚柔性和亲水性怎么表示 已有2人参与

如题,在聚合物链中,由于主链上是否还带其它基团(如甲基)对宏观性能影响很大,现在只能猜测是这两个因素,
一个是链的刚柔性不一样,另一个是链的亲水性不一样,想通过分子模拟来求证,可是要怎么表征呢?
请大侠指点,金币好说
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fanc232

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
亲水性疏水性,你把没加甲基的体系,和加了甲基的体系,分别放在溶剂里做个比较彻底的能量最小化,找到它在溶剂里最可能的构象,然后分别测一下暴露在溶剂中的亲水性基团和疏水基团的面积,做个比例,二者比较一下大小。
刚柔性,你指的是,加入甲基引进了空间位阻和其它作用力,有没有影响链的构象变化吧。要不你试试在链上选几个重要的可旋转键形成的二面角,看看在分子模拟过程中,二面角的范围有没有变狭窄,如果是,那估计就是刚性增加柔性减弱了。
NOTE!!我没做过那么多分子动力学模拟,这就是我一个想法而已,你再跟其他人多商量商量再确定吧。
我很喜欢计算机辅助药物设计
6楼2014-12-26 09:01:43
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

补充一点,这个聚合物本身就具有一定的水溶性,我看论坛里都说用接触角仪测接触角,对于水溶性的聚合物也适用吗?
2楼2014-12-25 18:25:53
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ktwyw

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没看懂你具体的问题。高分子物理里表征链的静态柔顺性的参数是持久长度,水溶性你可以去查聚合物与水的Flory-huggins参数,这些物理量实验上都可以测,分子模拟里面原则上也可以算,这样算回答你的问题么?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好学习,天天向上。
3楼2014-12-25 18:46:12
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

打个比方,如下图,左边和右边聚合物的区别在于右边的主链上挂了一个甲基,那么我现在想比较两者的分子刚柔性和亲水性,请问如何通过分子模拟来表征呢?
分子模拟中刚柔性和亲水性怎么表示
1.png

4楼2014-12-25 19:00:17
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