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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 73 (初中生)
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[求助] 分子模拟中刚柔性和亲水性怎么表示已有2人参与

如题，在聚合物链中，由于主链上是否还带其它基团（如甲基）对宏观性能影响很大，现在只能猜测是这两个因素，
一个是链的刚柔性不一样，另一个是链的亲水性不一样，想通过分子模拟来求证，可是要怎么表征呢？
请大侠指点，金币好说

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1楼 2014-12-25 18:17:17

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fanc232

新虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

亲水性疏水性，你把没加甲基的体系，和加了甲基的体系，分别放在溶剂里做个比较彻底的能量最小化，找到它在溶剂里最可能的构象，然后分别测一下暴露在溶剂中的亲水性基团和疏水基团的面积，做个比例，二者比较一下大小。
刚柔性，你指的是，加入甲基引进了空间位阻和其它作用力，有没有影响链的构象变化吧。要不你试试在链上选几个重要的可旋转键形成的二面角，看看在分子模拟过程中，二面角的范围有没有变狭窄，如果是，那估计就是刚性增加柔性减弱了。
NOTE！！我没做过那么多分子动力学模拟，这就是我一个想法而已，你再跟其他人多商量商量再确定吧。